一項新技術,將大大提高調查的表觀基因組,打開和關閉基因的機器和一個非常重要的研究領域疾病的干細胞分化、炎癥和癌癥。

表觀基因組的考核需要映射在整個基因組DNA與某種相互作用蛋白質。 這可能epigenomic特性允許醫(yī)生創(chuàng)建個性化治療的疾病,通過了解病人的狀態(tài),使預報,并相應調整治療策略。 然而,這樣的測試需要大量的 細胞 。 體內全基因組的研究一度protein-DNA交互和染色質的修改需要大約1000萬個細胞,一個單獨的測試。 這個巨大的需求幾乎排除這樣的患者樣本分析。

遠超過十年,張陸,弗吉尼亞理工大學的化學工程教授一直從事開發(fā)工具來有效地分析活細胞的長期目標,獲得更好的理解的一系列疾病。 在他的實驗室里和他的學生發(fā)展小微流控設備,測微計特性研究細胞內分子事件。

微流體是科學的一個分支,處理性能,控制和治療的液體以某種方式受到限制。

最新的突破來自陸與Kai Tan愛荷華大學的合作,系統(tǒng)生物學家和內科醫(yī)學副教授。 在一起,他們證明了一種叫做基于微流體振蕩清洗染色質免疫沉淀反應(MOWChIP-Seq)允許分析epigenomic修改使用只有100個細胞。

美國國立衛(wèi)生研究院以及種子格蘭特從弗吉尼亞理工大學的關鍵技術與應用科學研究所資助的這項工作。

“使用填充床的珠子芯片允許我們收集的染色質片段非常高的效率。 同時,有效的清洗去除不想要的分子和碎片保證收集到的分子的純度。 這兩個因素構成一個成功的戰(zhàn)略epigenomic分析和極高的靈敏度。

整個MOWChIP過程大約需要90分鐘,而不是幾個小時,傳統(tǒng)芯片分析。

他們用他們的 技術 研究造血干細胞和祖細胞的表觀基因組與小鼠的胎兒。

譚說:“是知之甚少的動態(tài)表觀基因組在胚胎造血作用,很大程度上是由于很難隔離足夠數(shù)量的這些細胞發(fā)展embyros。 這種技術是完美的工具,用于解決這個問題。”

”我們的技術為研究鋪平了道路與極低的表觀基因組的細胞數(shù)量從動物和病人,”陸說。 由幾個國家衛(wèi)生研究院資助,該小組計劃使用這一技術來研究其他epigenomic改變參與炎癥和癌癥在不久的將來。

弗吉尼亞理工大學知識產權提起了一個實用專利MOWChIP-Seq代表。