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Cell:mRNA,蛋白與代謝的協(xié)奏曲

日期:2016-03-18 08:57:55

 我們每個人心中都應(yīng)該有一張時間表,什么時候該做什么,只不過有的人能堅持按照時間表來做自己的時候,有的人則無法做到。然而對于細胞來說,它們的時間表自細胞生成那天起就決定了,了解這一時間表能幫助我們理解細胞生長和與其它細胞溝通的方式。最新一期(310日)Cell雜志整理了細胞進程的各種數(shù)據(jù)。

 

什么決定了細胞組件半衰期?

 

細胞成分,如代謝產(chǎn)物、 mRNA和蛋白都有不同的周期時間表,細胞池中單個代謝產(chǎn)物的半衰期取決于代謝池大小與代謝通量之間的比率,mRNA的半衰期則是由核酸酶降解半衰期決定的,而蛋白更為穩(wěn)定,通常是要比實驗室中快速倍增時間要慢一些降解,不過在細胞分裂過程中蛋白含量會減少,為此細胞也會進行一些補救措施,如快速調(diào)節(jié)蛋白水解過程。

 

在體內(nèi)蛋白代謝是一個動態(tài)過程,即在合成機體組織新蛋白質(zhì)的同時,原有的組織蛋白可被降解成氨基酸,降解形成的氨基酸又可以用于合成組織蛋白從而實現(xiàn)組織蛋白的不斷更新替換。這種蛋白質(zhì)就始終處于一個動態(tài)平衡體系中。Waterlow1978年用“蛋白質(zhì)周轉(zhuǎn)”(protein turnover)這一術(shù)語來描述蛋白質(zhì)在體內(nèi)的動態(tài)變化。蛋白質(zhì)周轉(zhuǎn)代謝是生物表現(xiàn)生命活動力的重要動力學(xué)過程。

 

近期研究人員開發(fā)出了一種雙熒光蛋白質(zhì)周轉(zhuǎn)分析(ProTA)技術(shù),并應(yīng)用這一技術(shù)定量繪制出了在BTZ誘導(dǎo)蛋白酶體抑制的情況下人類蛋白質(zhì)降解組的整體變化。這為繪制人類蛋白質(zhì)降解組圖譜,闡明藥物作用及耐藥潛在機制提供了一種新工具,有可能推動開發(fā)出靶向蛋白內(nèi)穩(wěn)態(tài)的治療方法來治療一些人類疾病。

 

哺乳動物細胞比細胞細胞慢嗎?

 

細菌和哺乳動物細胞具有相似的物理和化學(xué)參數(shù),如擴散系數(shù),RNA聚合酶和核糖體之間的比例等。但是由于哺乳動物細胞體積更大,基因長度也更長,因此功能時間表也會相應(yīng)的延長。舉例來說,1μ m大小細菌細胞的一個蛋白在細胞中的擴散只需要0.1秒,而10μ m 的哺乳動物細胞則需要10秒。

 

同樣,細菌平均的基因為1kb長,因此轉(zhuǎn)錄需要大約1分鐘;哺乳動物基因平均為10kb長,需要10分鐘。還有類似的時間表也會由于額外的細胞內(nèi)進程而受到影響,這些關(guān)鍵的進程在細菌中1秒能完成,哺乳動物則需要1分鐘。

 

蛋白如何及時穿過神經(jīng)元

 

一個蛋白要從軸突一角到達1厘米長神經(jīng)元的胞體位置,可能存在兩種主要機制。首先是擴散(D10 μm2/s),這大約需要花費一個月時間(R2/D),另外一種就是利用分子馬達,分子馬達的速度大約為1 μ m/s ,可以在幾小時內(nèi)運輸?shù)鞍走_到目的地。在超過一米長的神經(jīng)元中(人體和長頸鹿都有)即使用了分子馬達,這個過程也需要幾天的時間。

 

哈佛大學(xué)的一項研究提出過一種新的細胞質(zhì)模型,指出就像用勺子攪動咖啡里的糖一樣,細胞機器的運行讓細胞質(zhì)里的懸浮顆粒無法平靜。細胞質(zhì)的波濤主要是由分子馬達反復(fù)拉動肌動球蛋白(actomyosin)引起的,不過其它酶促活動也能掀起波瀾。

 

研究人員認為分子馬達和酶促反應(yīng)的活性改變,會影響細胞質(zhì)硬度和物質(zhì)運輸?shù)娜菀壮潭?。而細胞質(zhì)的改變又會進一步影響下游的細胞活性。

 

特別關(guān)注