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單細胞分析解釋印記相關疾病

日期:2016-04-06 09:29:13

 眾所周知,人體中的每個細胞都有兩套基因組,一套來自母親,一套來自父親。然而,研究人員目前仍不清楚每套基因組的具體表達情況。為此,美國賓夕法尼亞大學的研究人員開發(fā)出一種新技術,并用它來研究罕見病。這項成果于近日發(fā)表在《Genes & Development》上。

 

對于大多數(shù)基因,人們都遺傳了兩個拷貝,分別來自父親和母親。不過,在基因組印記發(fā)生時,后代只遺傳了一個有用的拷貝。卵子或精子形成過程中添加的甲基控制了基因的表達,使得DNA不轉錄成RNA,進而翻譯成蛋白質。

 

少數(shù)基因受到印記的影響,但卻對正常發(fā)育很關鍵。在正常情況下,只有母本或父本的染色體上的印記基因打開,但不會同時打開。若兩條染色體上的基因都打開或都關閉,則意味著疾病發(fā)生。異常表達可能與基因突變有關,也可能是甲基化發(fā)生了錯誤。

 

基因組印記引起的疾病是十分罕見的。研究人員此次研究了兩種:Russell-Silver綜合征和Beckwith-Wiedemann綜合征。Russell-Silver綜合征的癥狀為身材矮小,肢體或面部不對稱。這種疾病與H19IGF2兩個基因的甲基化不足有關。Beckwith-Wiedemann綜合征則是一種先天過度生長的疾病,其特征為兒童期癌癥風險增加,以及出生體重超標等。

 

研究小組以小鼠為模型,比較了正常小鼠和Russell-Silver綜合征小鼠的基因組。在細胞群體水平,Russell-Silver小鼠表達母本和父本的H19。之后,他們利用一種分子探針來檢測母本和父本之間RNA的單核苷酸變化。這種方法測定了單細胞中特異的變異表達。他們發(fā)現(xiàn),對于Russell-Silver綜合征小鼠,一些細胞有著母本和父本的RNA(異常),而另一些細胞只有母本RNA(正常)。

 

Russell-Silver小鼠中,所有細胞都有著相同的遺傳變化,但并非所有細胞都有著相同的DNA甲基化模式,這解釋了基因表達的鑲嵌結構。兩個突變細胞亞群在各自基因組的印記控制區(qū)域表現(xiàn)出不同的甲基化模式。只表達母本H19的細胞有著正確的DNA甲基化模式,而表達母本和父本H19的細胞表現(xiàn)出H19 DNA甲基化的損失。重要的是,他們在小鼠心臟組織中也觀察到這兩個亞群,表明整個小鼠都存在同樣的缺陷。

 

研究人員表示,這是第一次在單細胞水平證明了表觀遺傳嵌合體的存在。研究結果表明,印記疾病可能表現(xiàn)出驚人的單細胞異質性,而這種異質性可能解釋了表觀遺傳嵌合體的存在。