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Nature子刊發(fā)布突破性單細胞標記技術(shù)

日期:2016-05-26 10:43:39

 加拿大蒙特利爾大學和麥吉爾大學的研究團隊在Nature Communications雜志上發(fā)布了一種強大的單細胞標記技術(shù)。這種光漂白細胞標記法(CLaP)將成為研究者們的寶貴工具,廣泛用于各個領(lǐng)域的科學研究,特別是基因組學研究。

 

“我們把激光當作畫筆,一個一個地標記細胞,”蒙特利爾大學副教授Santiago Costantino說。“過去,標記特定細胞需要事先知道它的分子信息,否則只能通過非特異性方法標記一大群細胞。我們開發(fā)的新技術(shù)僅僅根據(jù)觀測信息來涂色,比如只標記體形大的細胞、速度快的細胞或者瘦長的細胞。隨后,人們可以在分子水平上研究了這些細胞的特殊之處。這種標記技術(shù)能夠在數(shù)百萬正常細胞中找到罕見的特殊細胞。”

 

CLaP使用起來非常簡單,成本也不高,適合標準共聚焦顯微鏡。CLaP能夠通過自動化實現(xiàn)高通量標記,并且對細胞沒有任何損傷。這種用途廣泛的非侵入性高效標記法,將大大推動新一代測序在單細胞基因組領(lǐng)域的應用。

 

近年來蓬勃發(fā)展的單細胞基因組學研究改變了人們對許多疾病的認識。越來越多的研究表明,隱藏在數(shù)百萬細胞中的罕見細胞會起到重要的作用。“我們開發(fā)的技術(shù)可以幫助人們挑出這些細胞,進行一系列過去無法實現(xiàn)的試驗,”麥吉爾大學助理教授Dr. Claudia Kleinman說。

 

多細胞生物的每個細胞都攜帶著相同的遺傳學信息。但科學家們發(fā)現(xiàn),每一個細胞都是獨一無二的。不同類型的細胞激活特定的基因組合,即使是同類細胞,基因表達也會出現(xiàn)差異。The Scientist雜志最近聯(lián)系了單細胞研究領(lǐng)域的一些專家,請他們分享了在單細胞中進行轉(zhuǎn)錄研究的秘訣。希望幫助研究者們更好地構(gòu)建文庫,處理和分析結(jié)果數(shù)據(jù)。

 

單細胞基因組旨在通過組學方法研究單個細胞。近年來隨著技術(shù)的發(fā)展,這一年輕的領(lǐng)域正在迅速成熟起來。單細胞基因組研究的前身可以追溯到用芯片檢測單細胞的基因表達。不過,新一代DNA測序才是單細胞基因組學的大功臣,這些技術(shù)的出現(xiàn)讓單細胞基因組研究最終一飛沖天。

 

統(tǒng)計和計算方法是單細胞基因組研究的核心,只有正確的方法才能幫助我們從數(shù)據(jù)中提取有意義的生物學信息。前不久,德克薩斯大學MD安德森癌癥中心的研究人員開發(fā)了首個用于單細胞DNA測序的突變檢出程序——Monovar,這一重要研究成果發(fā)表在Nature Methods雜志上。研究人員認為Monovar是單細胞測序評估SNV的一大進步,能夠為人們提供多種疾病的關(guān)鍵信息。

 

特別關(guān)注