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盧煜明教授PNAS發(fā)布第二代無創(chuàng)胎兒基因組分析結(jié)果

日期:2016-11-02 09:20:31

 今年9月,堪稱“中國諾貝爾”的未來科學(xué)大獎揭曉。香港中文大學(xué)李嘉誠健康科學(xué)研究所的盧煜明(Dennis Ming Yuk Lo)教授因發(fā)現(xiàn)可以從母親血液中提取到胎兒DNA,而獲得高達(dá)100萬美元的生命科學(xué)大獎獎金。

 

作為無創(chuàng)DNA產(chǎn)前檢測的奠基人,盧教授早在1997年就發(fā)現(xiàn)了孕婦外周血中存在游離的胎兒DNA,并發(fā)展出了一套新技術(shù)來準(zhǔn)確分析和度量母親血漿內(nèi)的胎兒DNA,也因此當(dāng)選英國皇家學(xué)會院士,2013年當(dāng)選美國國家科學(xué)院外籍院士。

 

其研究組近期發(fā)表了題為“Second generation noninvasive fetal genome analysis reveals de novo mutations, single-base parental inheritance, and preferred DNA ends ”的文章,通過針對母體血漿DNA進(jìn)行全基因組測序,探索了第二代無創(chuàng)性胎兒全基因組分析方法的限制與改良。這一研究成果公布在1031日《美國國家科學(xué)院院刊》(PNAS)雜志上。

 

第一代無創(chuàng)產(chǎn)前診斷是通過染色體倍數(shù)異常來判斷的,最典型的就是先抽取孕婦的外周血,提取游離DNA,通過高通量測序技術(shù)分析每染色體片段,判斷胎兒是否是21號三倍體。第二代無創(chuàng)產(chǎn)前診斷分析的是基因突變診斷。

 

設(shè)想母親在某個基因的某個位置上的核苷酸是Aa, 如果胎兒的是致病的aa型。那么,考慮到胎兒的DNA在孕婦的血液中只占5%. 通過對孕婦的外周血的超高通量測序(1000倍覆蓋),如果測出來A占了42.5%, a占了47.5%,我們就可斷定胎兒的基因型是aa. 這里的關(guān)鍵是測序深度要非常高,1000X

 

最新這篇文章通過針對母體血漿DNA進(jìn)行全基因組測序(195×和270×單倍體基因組覆蓋),探索無創(chuàng)性產(chǎn)前檢測的限制范圍。研究人員結(jié)合一系列生物信息學(xué)篩選,完成了高于之前報道兩個數(shù)量級的陽性預(yù)測值檢測胎兒新發(fā)突變。

 

并且研究人員在一個CFC綜合征案例中無創(chuàng)發(fā)現(xiàn)了一個新發(fā)BRAF突變,CFC綜合癥主要出現(xiàn)在心臟方面,包括肺動脈狹窄、瓣膜發(fā)育不良等,通常病患沒有眉毛和眼睫毛,其指甲呈現(xiàn)發(fā)育不良或生長過快,這一綜合征的致病基因?qū)儆?span lang="EN-US">RAS-ERK訊息傳遞路徑中的成員。

 

研究人員指出胎兒母系遺傳可以通過全基因組分析確定,而無需母體單倍體信息,從而極大的增加了此類分析的分辨率。這些研究表明血漿DNA 片段末端(胎兒或母體篩選)的某些基因組位點可能存在重復(fù)報道。

 

特別關(guān)注