DNA同源重組的新發(fā)現(xiàn)
日期:2016-12-14 09:09:03
今年4月,清華大學(xué)博士生導(dǎo)師王宏偉教授接替施一公教授,成為生命科學(xué)學(xué)院院長(施一公不再擔(dān)任清華大學(xué)生科院院長)。王教授主要從事冷凍電子顯微學(xué)研究,利用這一技術(shù)分析生物大分子復(fù)合體的結(jié)構(gòu)與分子機(jī)理。12月12日,其研究組在Nature Structural & Molecular Biology雜志上公布了最新研究成果:獲得了人RAD51-DNA復(fù)合物的近原子分辨率結(jié)構(gòu),這對于解析DNA同源重組過程中的分子機(jī)制具有重要意義。
在真核細(xì)胞中,非同源末端連接(NHEJ)和同源重組(HR)是介導(dǎo)DSB修復(fù)的兩個重要信號通路。其中HR利用了姐妹染色單體中的同源序列作為模板來引導(dǎo)修復(fù)合成及恢復(fù)染色體完整性,是一種無錯誤的DSB修復(fù)機(jī)制。
研究顯示,真核生物中同源重組的一個關(guān)鍵步驟在于一種稱為Rad51重組酶,這種蛋白發(fā)揮著鏈轉(zhuǎn)移或鏈交換活性,啟動DNA同源配對的作用,即在單鏈DNA(ssDNA)上組裝,生成螺旋纖維搜索同源雙鏈DNA(dsDNA),從而在最初的單鏈DNA與互補(bǔ)鏈之間形成新的配對堿基。關(guān)于這個過程,還存在許多未解之謎。
在這篇文章中,研究人員利用冷凍電鏡cryo-EM技術(shù)獲取了突觸前和突觸后人RAD51-DNA復(fù)合物的近原子分辨率結(jié)構(gòu),這對于解析DNA同源重組過程中的分子機(jī)制具有重要意義。
從這一結(jié)構(gòu)中,研究人員發(fā)現(xiàn)了人RAD51-DNA復(fù)合物與相應(yīng)原核生物復(fù)合物的相同與不同的結(jié)構(gòu)特征,其中特別值得注意的是這一研究也捕獲了突觸復(fù)合物結(jié)構(gòu),從而為了解同源搜索,DNA鏈交換過程提出了新的見解。
冷凍電鏡技術(shù)對于結(jié)構(gòu)生物學(xué)的發(fā)展具有重要意義,1995年,Richard Henderson曾作過一個大膽的預(yù)測:在理想條件下,用冷凍電鏡cryo-EM檢測蛋白結(jié)構(gòu),應(yīng)該可以達(dá)到3 Å的分辨率。其后這個預(yù)言很快就實(shí)現(xiàn)了。2013年發(fā)表的兩項冷凍電鏡研究就采用了新型檢測設(shè)備,將cryo-EM的分辨率推向極限。在此之后這一技術(shù)領(lǐng)域的不少成果不斷涌現(xiàn)。
今年7月,王宏偉教授課題組還利用這一技術(shù)析了酵母Exo-Ski7的RNA-free和RNA-bound兩種構(gòu)象的4.2埃和5.8埃的三維結(jié)構(gòu),并通過觀察一系列RNA結(jié)合狀態(tài)的Exosome復(fù)合體的結(jié)構(gòu)差異揭示了RNA底物介導(dǎo)的Exosome復(fù)合物構(gòu)象轉(zhuǎn)化過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用的結(jié)構(gòu)元件。
研究人員結(jié)合生化數(shù)據(jù),揭示Ski7和Rrp6與十亞基Exosome復(fù)合物結(jié)合的競爭性關(guān)系,提出Exosome復(fù)合物在不同亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)選擇不同RNA底物進(jìn)行降解的可能機(jī)制。