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青年千人學者發(fā)表Cell新文章:兩種新型CRISPR-Cas系統(tǒng)

日期:2016-12-22 09:01:10

 來自中科院生物物理所,美國Sloan研究所的研究人員發(fā)表了題為“PAM-Dependent Target DNA Recognition and Cleavage by C2c1 CRISPR-Cas Endonuclease”的文章,介紹了近年來新發(fā)現(xiàn)的CRISPR-Cas系統(tǒng):CRISPR-C2c1,他們解析了C2c1-sgRNA二元復合物及C2c1-sgRNA-DNA多種三元復合物結(jié)構(gòu),并明確了C2c1對雙鏈DNA的切割會產(chǎn)生7nt的粘性末端,這是目前所有用于基因組編輯的CRISPR-Cas系統(tǒng)所能產(chǎn)生的最長粘性末端。

 

這一研究成果公布在1215日的Cell雜志上,研究人員包括中科院生物物理所國家“青年千人計劃”高璞研究員,他與Sloan研究所的Dinshaw J. Patel教授合作,還曾在Cell Research 雜志上發(fā)文,報道了另外一種CRISPR-Cas系統(tǒng):CRISPR-Cpf1。

 

CRISPR-Cpf1也能在crRNA的引導下在人類細胞中剪切目標DNA,被稱為是新一代的CRISPR基因組編輯系統(tǒng)。今年8月,這一研究組發(fā)文揭示了CRISPR-Cpf1識別目標DNA的獨特機制。他們解析了Cpf1-crRNA-DNA三元復合物,并詳細分析了target DNA結(jié)合前后的構(gòu)象變化,提出了有別于Cas9DNA識別機制?;诮Y(jié)構(gòu)的分析,他們推測Cpf1系統(tǒng)相較于Cas9可能具備更低的脫靶效應(yīng)。

 

除了Cpf1,去年Broad研究所的張鋒研究組還采用了一種新生物信息學方法發(fā)現(xiàn)了暫時被命名為C2c1、C2c2C2c3的新蛋白,他們開發(fā)出一系列的計算方法來搜索NIH基因組數(shù)據(jù)庫,鑒別新的CRISPR-Cas系統(tǒng)。但對于這種新系統(tǒng),科學家們了解的不多。

 

在最新這項研究中,高璞課題組與Patel教授等人首先解析了C2c1-sgRNA二元復合物及C2c1-sgRNA-DNA多種三元復合物結(jié)構(gòu)。并且他們通過結(jié)構(gòu)分析,揭示了C2c1不同于Cas9Cpf1的獨特target DNA識別和切割方式。

 

同時在之后的生化實驗中,研究人員首次明確了C2c1對雙鏈DNA的切割會產(chǎn)生7nt的粘性末端。這是目前所有用于基因組編輯的CRISPR-Cas系統(tǒng)所能產(chǎn)生的最長粘性末端,將有希望提高切割后的連接效率。

 

特別關(guān)注