Cell:闡明活細(xì)胞中蛋白質(zhì)凝縮的新工具
日期:2017-01-03 09:10:03
一種利用光來控制活細(xì)胞內(nèi)物質(zhì)的工具,已經(jīng)開始為我們解釋“蛋白質(zhì)如何組裝成不同的液體和凝膠狀固態(tài)”,這對于理解許多關(guān)鍵的細(xì)胞運轉(zhuǎn),是至關(guān)重要的。
由于極大的復(fù)雜性,宿主細(xì)胞會同時發(fā)生成千上萬的化學(xué)反應(yīng)。一些反應(yīng)發(fā)生在專門的隔間里,稱為細(xì)胞器。然而,某些細(xì)胞器沒有任何細(xì)胞膜,將它們與細(xì)胞內(nèi)漂浮的其他物質(zhì)隔開。這些無膜細(xì)胞器以某種方式作為細(xì)胞質(zhì)、蛋白質(zhì)、核酸等大分子當(dāng)中的獨立結(jié)構(gòu)。
目前,普林斯頓大學(xué)的科學(xué)家們開發(fā)出一種新的工具——被稱為optoDroplet,給我們提供了前所未有的機會來操縱和理解允許無膜細(xì)胞器發(fā)揮功能的化學(xué)機制。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在12月29日的《Cell》雜志。
本文資深作者、普林斯頓大學(xué)細(xì)胞化學(xué)和生物工程助理教授Clifford Brangwynne說:“這種optoDroplet工具開始讓我們仔細(xì)分析控制無膜細(xì)胞器組裝的物理和化學(xué)規(guī)則。我們對這個過程的根本機制了解甚少,如果我們了解了它,就有可能為與蛋白質(zhì)聚集相關(guān)的嚴(yán)重疾?。ㄈ?/span>ALS)開發(fā)出干預(yù)和治療措施。”
以往的研究已經(jīng)證明,無膜細(xì)胞器在細(xì)胞內(nèi)聚集的過程稱為相變:常見的相變的例子包括,水蒸氣冷凝成露滴或液態(tài)水凍成堅冰。Brangwynne及其同事們在過去幾年的研究表明,改變某些蛋白質(zhì)的濃度,或修改其結(jié)構(gòu),似乎能觸發(fā)一種相位改變,使蛋白質(zhì)凝結(jié)成液滴狀的細(xì)胞器。
到目前為止,雖然大多數(shù)研究都使用試管中的純化蛋白質(zhì),但是研究人員很少有方法來研究活細(xì)胞中的相變。optoDroplets將幫助科學(xué)家們了解“相變出錯時,產(chǎn)生的固體狀凝膠和蛋白質(zhì)結(jié)晶聚集體會引發(fā)某些疾病(包括阿爾茨海默氏癥和ALS)”的更多信息。
optoDroplet依靠光遺傳學(xué)技術(shù),涉及的蛋白質(zhì)其行為可以通過光照改變。(細(xì)胞大多是水,基本上是透明的。)研究人員發(fā)現(xiàn),他們可以通過打開光激活的蛋白質(zhì),誘導(dǎo)相變和制備無膜細(xì)胞器。他們也可以通過簡單地把光關(guān)掉而取消相變。增加光強度和蛋白質(zhì)濃度,可允許研究人員進一步控制相變。通過改變這些輸入,他們可以確定何時凝聚液蛋白液滴形成以及固體狀蛋白質(zhì)聚集,可能與疾病相關(guān)。
Brangwynne說:“optoDroplet為我們提供了一個控制水平,可以用精確定位活細(xì)胞中的相圖。有了相圖,我們就開始了解細(xì)胞如何利用它們的自然機器,穿過這個細(xì)胞內(nèi)相圖來組裝不同類型的細(xì)胞器。”
該論文的第一作者是Brangwynne軟生物物質(zhì)研究組的博士后Yongdae Shin。這項工作是由美國國立衛(wèi)生研究院和國家科學(xué)基金會部分資助。
利用小鼠和人類細(xì)胞,該研究小組剪接了來自一種植物(鼠耳芥)的感光蛋白編碼基因,這種植物是甘藍和芥菜的近緣種,是遺傳學(xué)研究的主要模式植物。藍光照射可導(dǎo)致蛋蛋白質(zhì)自我結(jié)合,蜷縮起來。
感光標(biāo)簽與蛋白成分融合,被認(rèn)為可驅(qū)動活細(xì)胞中的相變。研究人員利用光,發(fā)現(xiàn)他們可以誘導(dǎo)蛋白蜷縮,從而模仿細(xì)胞中自然產(chǎn)生的冷凝過程。Brangwynne說:“利用水蒸氣的比喻,你可以認(rèn)為我們做的事情是,使用激光局部改變了一些地區(qū)的空氣溫度,水滴會凝結(jié)出來。”
該小組反復(fù)促使蛋白質(zhì)凝結(jié),然后通過打開和關(guān)閉光而溶解。這個過程被證明是完全可逆的,即使經(jīng)過多次循環(huán)。然而,用高強度的光或高濃度的蛋白質(zhì),研究人員制備了半固體凝膠。這些凝膠最初是可逆的,但隨著時間的推移,它們凝固形成了不可逆轉(zhuǎn)的塊狀凝聚體,類似于一些疾病中發(fā)現(xiàn)的。
Brangwynne說:“我們表明,通過optoDroplet,我們可以很容易地組裝和拆卸相分離的液體,它們似乎并沒有對細(xì)胞造成任何影響。但是,凝膠狀的組件似乎更具問題,因為經(jīng)過許多周期,它們發(fā)展成了持久的聚集體,細(xì)胞不能再進行處理,可能開始損壞健康的生物過程。”
一個例子就是所謂的FUS。FUS蛋白對于細(xì)胞的操作至關(guān)重要;它有助于產(chǎn)生其他蛋白質(zhì),并修復(fù)DNA損傷。但大量的遺傳突變可能會使FUS蛋白變得過于粘稠,從而引發(fā)ALS,也被稱為Lou Gehrig氏病。這種神經(jīng)系統(tǒng)疾病患者失去了主動控制肌肉的能力,ALS的特點是在神經(jīng)細(xì)胞中積累了蛋白質(zhì)團塊。這些蛋白質(zhì)團塊可能來源于FUS或其他蛋白病理聚集,而不是保持動態(tài)的液滴。亨廷頓氏病和老年性癡呆還涉及堵塞細(xì)胞的蛋白質(zhì)團塊,再次表明細(xì)胞中的異常相變與這些疾病密切相關(guān)。
歐洲分子生物學(xué)實驗室的研究人員Edward Lemke,沒有參與細(xì)胞的研究,但是他指出了optoDroplet的前景。Lemke說:“optoDroplet靶定的蛋白質(zhì),是相分離蛋白質(zhì)的一個重要組成部分,其中有許多與臭名昭著的疾病有關(guān)。optoDroplet系統(tǒng)可讓我們以一種微創(chuàng)和高度可控的方式,調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)這些蛋白的狀態(tài),所以它可以提供關(guān)于這些蛋白如何運作的新見解。”
Brangwynne和同事們期待著繼續(xù)用optoDroplet開展實驗,以更好地了解細(xì)胞的復(fù)雜行為。Brangwynne說:“這是我們正在做的基礎(chǔ)科學(xué),回答了關(guān)于細(xì)胞內(nèi)相變的基本問題。但我們希望這些見解不僅能揭示健康細(xì)胞是如何運轉(zhuǎn)的,還可以揭示它們是如何病變的,最終可能如何治愈。”