Cell:神秘的非編碼RNA在基因表達(dá)中起重要作用
日期:2017-01-16 10:00:48
在細(xì)胞中,DNA被轉(zhuǎn)錄成RNA,提供給細(xì)胞制造蛋白質(zhì)的分子配方。大多數(shù)的基因組被轉(zhuǎn)錄成RNA,但實(shí)際上只有一小部分的RNA是來自于基因組中的蛋白質(zhì)編碼區(qū)域。
賓夕法尼亞大學(xué)Perelman醫(yī)學(xué)院Penn表觀遺傳學(xué)研究所主任Shelley Berger博士說:“為什么非編碼區(qū)能轉(zhuǎn)錄?它們的功能一直是神秘的。”
Berger及其實(shí)驗(yàn)室的博士后Daniel Bose博士,研究來自增強(qiáng)子的基因表達(dá)調(diào)控,是基因組上離蛋白編碼區(qū)較遠(yuǎn)的非編碼區(qū)。增強(qiáng)子可提高附近的蛋白編碼基因的基因表達(dá)率,所以細(xì)胞能夠泵出更多所需的蛋白分子。一小部分神秘的非編碼RNA,稱為增強(qiáng)子RNAs(eRNAs)是從增強(qiáng)子序列轉(zhuǎn)錄而來的。雖然這些對于提高基因表達(dá)是非常重要的,但是它們是如何實(shí)現(xiàn)這一點(diǎn)的,仍然還是完全未知的。
通過揭示這些難以捉摸的eRNAs,他們表明,CBP——激活來自增強(qiáng)子的轉(zhuǎn)錄的一種酶,可直接結(jié)合eRNAs。這種簡單的行為通過調(diào)節(jié)乙?;瑏砜刂粕矬w內(nèi)的基因表達(dá)模式,這種化學(xué)標(biāo)記指導(dǎo)緊密包裝在細(xì)胞核中的DNA解開,以促進(jìn)轉(zhuǎn)錄。他們的研究結(jié)果發(fā)表在本周的《Cell》雜志。
Bose說:“我們體內(nèi)的細(xì)胞共享相同的基因和DNA序列,而這些基因表達(dá)的方式有所不同。增強(qiáng)子和eRNAs是這個過程的關(guān)鍵。我們的研究顯示了一種令人興奮的新方式,eRNAs通過這種方式產(chǎn)生這些不同的基因表達(dá)模式。我們想知道eRNAs是否直接與CBP協(xié)作,并想弄清它們是如何做到的。”
采用生化分析,他們發(fā)現(xiàn),CBP結(jié)合RNA的區(qū)域,也可以調(diào)節(jié)CBP與化學(xué)標(biāo)志協(xié)作的能力。通過結(jié)合這個區(qū)域,eRNAs可以直接刺激CBPs的乙酰化活性。
Berger說:“在癌癥生物學(xué)領(lǐng)域中,科學(xué)家對增強(qiáng)子和eRNAs的興趣越來越大,因?yàn)橛腥毕莸脑鰪?qiáng)子可能會導(dǎo)致產(chǎn)生過多或過少的蛋白質(zhì),或者會導(dǎo)致編碼區(qū)被關(guān)閉或打開,或在錯誤的時間制造一個蛋白。”對于“增強(qiáng)子和eRNAs如何發(fā)揮功能”了解更多,將對腫瘤學(xué)家有幫助,因?yàn)樽罱祟惸[瘤的DNA測序表明,與癌癥及其他疾病相關(guān)的大量基因突變,發(fā)生在基因組的增強(qiáng)子區(qū)域——而不是蛋白質(zhì)編碼區(qū)。
Berger說:“從根本上說,這是一門重要的科學(xué),因?yàn)槲覀儼l(fā)現(xiàn),在整個基因組和身體中,增強(qiáng)子RNAs對于指導(dǎo)蛋白質(zhì)的生產(chǎn)有關(guān)鍵作用。我們發(fā)現(xiàn),在整個基因組中,增強(qiáng)子RNAs是與CBP結(jié)合的最常見的RNA類型,并且,通過這樣的互動,eRNAs對于調(diào)節(jié)CBP活性和基因表達(dá),起著至關(guān)重要的作用。”