華人科學家的癌基因新發(fā)現(xiàn)
日期:2010-06-02 11:34:34
文章的通訊作者是Genetech公司的張澤民(Zemin Zhang,音譯)博士,其早年畢業(yè)于南開大學,之后獲得賓夕法尼亞州立大學博士學位,主要研究興趣是癌癥基因組學,其研究組利用計算機方法嘗試預測疾病基因突變。
全球每年由于吸煙導致肺癌的病例數(shù)不勝數(shù),在工業(yè)發(fā)達國家中如美國等,肺癌的發(fā)病率占常見癌癥的首位,為第一位癌癥死亡原因。煙草中的致癌物如3,4-苯并芘、煙焦油等的致癌作用是一致公認的。
今年一月,英國劍橋大學韋爾科姆基金會桑格學院的研究人員利用大規(guī)模高通量測序技術,對小細胞肺癌細胞系:NCI-H209進行了測序分析,發(fā)現(xiàn)了與吸煙有關的突變。他們發(fā)現(xiàn)了22910個候選因子,其中還包括了134個編碼外顯子。
而最新的這項研究發(fā)現(xiàn)了超過5萬個基因點突變,其中530個得到確認,它們當中392個在編碼區(qū)域,包括以前已知的變異,如KRAS“原致癌基因”突變和放大。這些數(shù)據(jù)表明,遺傳上復雜的腫瘤可能包含很多部分冗余的突變,而且要識別復發(fā)性致癌“驅動突變”(driver mutation),將需要對很多尚未測序的樣本進行測序。
完整基因組測序為包括肺癌在內(nèi)的若干種癌癥類型的突變譜提供了線索。在這篇文章中,研究人員從全基因組范圍內(nèi)來觀察突變差異,他們對一名煙齡超過15年,平均每天吸煙25根的原發(fā)性肺部腫瘤患者進行分析,將這名患者的癌細胞和相鄰正常組織的完整序列進行了比較。發(fā)現(xiàn)了多達5萬個基因突變,這一數(shù)目非常龐大,過去從未有研究發(fā)現(xiàn)如此多的基因突變
研究人員認為這可能和患者的煙齡有關,通過這一患者吸煙的數(shù)量和基因突變的比例來看,籠統(tǒng)來說就是每吸三根煙即可能產(chǎn)生一個基因突變。當然具體的情況更為負責,但是研究人員也指出,雖然人體的DNA修復機制能部分修復由于吸煙帶來的傷害,但是吸煙時間越長,這種機制功能就越差。
除此之外,研究人員還在這5萬個基因中找到了392個在編碼區(qū)域的突變,包括以前已知的變異,如KRAS原致癌基因突變和放大。這些數(shù)據(jù)表明,遺傳上復雜的腫瘤可能包含很多部分冗余的突變。
另外近期科學家們還發(fā)現(xiàn)了非煙民罹患肺癌相關的基因,如果這個基因發(fā)生變異,活性降低,則罹患肺癌風險可能增高。這一發(fā)現(xiàn)有助于進一步研究肺癌靶向治療和預測罹患肺癌高危人群。
這種基因名為GPC5,研究人員發(fā)現(xiàn),GPC5基因發(fā)生變異可能使非煙民罹患肺癌的風險增加。研究人員進一步研究發(fā)還現(xiàn),與健康人的肺部相比,肺腺癌患者的GPC5基因活性低50%。肺腺癌是一種最常見的肺癌。
研究人員據(jù)此認為,GPC5活性低可能導致非煙民罹患肺癌,有望通過進一步研究這一基因,研發(fā)肺癌靶向治療新方法,并辨別罹患肺癌高危人群。這是首次確認某個特定基因影響非煙民罹患肺癌風險。
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