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家蠶基因組甲基化譜完成

日期:2010-07-15 16:43:47

由中國科學(xué)院昆明動物研究所、深圳華大基因研究院、西南大學(xué)、上海腫瘤所等合作的研究成果“家蠶基因組甲基化譜”,5月2日在國際著名學(xué)術(shù)雜志《自然—生物技術(shù)》(Nature Biotechnology)上發(fā)表,這是中國科學(xué)家在家蠶基因組研究領(lǐng)域取得的又一項重要成果。
 
作為表觀遺傳學(xué)的一種重要標記,DNA甲基化在基因組防御、基因調(diào)控等方面都發(fā)揮著重要作用。相對于動植物,昆蟲甲基化水平很低,其功能也一直存在爭議。近年來,隨著越來越多昆蟲甲基化基因和甲基化酶的報道,昆蟲甲基化的功能和生物學(xué)意義引起了廣泛的興趣。
 
最近,中國科學(xué)院昆明動物研究所王文研究員領(lǐng)導(dǎo)的馬普小組的相輝博士等,與深圳華大基因研究院、西南大學(xué)蠶桑學(xué)重點實驗室以及上海腫瘤所的朱景德研究員小組共同合作,利用新一代測序技術(shù)構(gòu)建了第一張單堿基分辨率的昆蟲甲基化譜——家蠶絲腺甲基化譜。
 
研究發(fā)現(xiàn)大約0.11%的基因組胞嘧啶被甲基化修飾,比哺乳動物和植物低至少50倍。甲基化區(qū)域主要富集在基因區(qū),并且與基因表達水平成正相關(guān)。動植物中被報道發(fā)揮重要作用的啟動子區(qū)、核糖體rDNA區(qū)甲基化調(diào)控,以及轉(zhuǎn)座子區(qū)的甲基化抑制,在昆蟲中似乎還不具備。
 
家蠶甲基化譜的完成不但對理解昆蟲表觀遺傳學(xué)調(diào)控的提供了重要的參考資料,也為進一步發(fā)掘家蠶人工馴化過程中潛在的表觀遺傳學(xué)貢獻奠定了研究基礎(chǔ)。
特別關(guān)注