基因診斷技術(shù)的質(zhì)控指標(biāo)
日期:2010-08-02 13:54:34
臨床醫(yī)生了解基因診斷質(zhì)控指標(biāo)的含義,對于合理地選擇檢測方法和正確地分析與解釋結(jié)果有很大的價值。
1.靈敏度
簡單地說,靈敏度就是檢測的最小值。一般來說,我們希望某一種檢測技術(shù)的敏感度越高越好。理想地,病原體分離培養(yǎng)時能從待測標(biāo)本中找到一個細(xì)菌或一個病毒顆?;蚱渌魏我粋€病原體;免疫學(xué)檢測時,能測出一個抗原或抗體分子,等等,但這些通常都很難做到。然而基因檢測則能達(dá)到這個理想境界,但在臨床實踐中,我們的確需要這么高的靈敏度嗎?太高的靈敏度會對結(jié)果的可靠性帶來什么影響呢?我們應(yīng)當(dāng)將這兩個問題結(jié)合起來考慮,才能對某一檢測項目的錄敏度有一個正確的認(rèn)識,不應(yīng)一味追求高靈敏度
2.精確性
精確性就是真實性,我們希望任何一個檢測技術(shù)的精確性越高越好,希望獲得的結(jié)果是與患者的病情吻合的。但是精確性要受下述兩個條件的制約:第一,技術(shù)本身可能存在的局限性。第二,實驗室條件和操作技能。大家都知道PCR法最難克服就是假陽性的問題,實驗室內(nèi)產(chǎn)物污染會毀掉一個實驗室,而恢復(fù)一個實驗室的正常檢測需要相當(dāng)長的時間、做許多的工作和浪費大量的人力、物力。假陰性也同樣給臨床工作帶來不便。
3.特異性
特異性與精確性有一定關(guān)系,但不能與精確性混為一談。假陽性率和假陰性率的高低是衡量基因檢測技術(shù)特異性的兩大指標(biāo)。前面談到的PCR產(chǎn)物污染所致的假陽性主要與實驗室條件和操作技能有關(guān),嚴(yán)格地講與特異性高低的關(guān)系不大。特別性是由檢測手段的內(nèi)在因素決定的。決定基因檢測的特異性的因素有以下幾個:第二,待測目的基因的特異性。首先,生物體有一個完整的基因組,基因組內(nèi)有各種基因,各有其功能,有些基因在同種、屬的不同型和株之間有很高的同源性,甚至是完全相同的;而有些基因在不同種、屬之間的同源性也很高,因此,我們在選擇待測基因時應(yīng)避開這些基因;其次,基因的保守性也很重要,選擇非保守區(qū)基因極易產(chǎn)生假陰性;最后,即使是在保守區(qū),也還存在保守程度的問題。第二,引物質(zhì)量。這主要針對PCR技術(shù)而言。保證引物質(zhì)量的主要因素之一,是保證其與基因擴(kuò)增片段上的引物區(qū)完全結(jié)合,而且與基因組序列其他區(qū)域的同源性不得超過70%;其他比較重要的因素有引物的Tm值、引物長度,形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)和引物二聚體的能量值。第三,探針的制備。這是針對雜交技術(shù)而言的。如果是寡核苷酸探針,其設(shè)計要求基本同引物。制備較長探針時除了要考慮第一個因素外,還要考慮標(biāo)記物的選擇,比如不宜選擇生物素標(biāo)記探針作原位雜交,因為組織細(xì)胞中含有大量生物素,去除困難。第四,標(biāo)本的準(zhǔn)備。標(biāo)本中的抑制物會干擾檢測結(jié)果,造成假陽性或假陰性。第五,檢測條件是否優(yōu)化。這里不是指實驗室條件,而是指檢測試劑的組合、各種試劑最佳濃度的選擇、雜交或擴(kuò)增溫度的優(yōu)化、雜交或擴(kuò)增時間的確定等。
4.可重復(fù)性
它與精確性有關(guān),但又不是完全由精確性所決定,因為可重復(fù)性的好壞牽涉到技術(shù)難度的問題。比如雜交法,看似簡單,尤其是微反應(yīng)板雜交,操作過程與酶聯(lián)免疫技術(shù)相似,但難度要比酶聯(lián)免疫技術(shù)大得多,檢測者必須有一定的技能,至少原來對酶聯(lián)免疫技術(shù)的檢測過程比較熟悉,否則應(yīng)當(dāng)經(jīng)過培訓(xùn)。PCR技術(shù),尤其是逆轉(zhuǎn)錄PCR技術(shù)的應(yīng)用,新手很容易失敗。
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