一種可用于多重連接依賴(lài)的擴(kuò)增技術(shù)的長(zhǎng)探針的制備方法
日期:2010-08-13 16:22:26
背景:2002年荷蘭科學(xué)家發(fā)明了一種名為多重連接依賴(lài)的擴(kuò)增技術(shù)(muitiplex ligation-dependent probe amplication,MLPA)的高通量基因檢測(cè)方法,可在同一反應(yīng)管內(nèi)對(duì)多達(dá)45種不同的核苷酸序列進(jìn)行檢測(cè)和定量分析。至今,MLPA技術(shù)已應(yīng)用于很多領(lǐng)域,如單核苷酸多態(tài)性和基因突變檢測(cè)、基因片段缺失和重復(fù)、染色體數(shù)目異常、基因甲基化檢測(cè)及mRNA分析等等。在該方法中涉及到長(zhǎng)探針和短探針,其中長(zhǎng)探針的制備是難點(diǎn)。
方法改進(jìn):采用PCR方法結(jié)合親和素磁珠法制備(long oligonucleotide preparation by magenetic-beads,LOPM)可用于多重連接依賴(lài)的擴(kuò)增技術(shù)的長(zhǎng)探針。通過(guò)針對(duì)目標(biāo)序列和用于制備長(zhǎng)探針的與待檢測(cè)靶片段無(wú)關(guān)的模板UT(Unrelated Template,UT),如質(zhì)粒等設(shè)計(jì)進(jìn)行PCR擴(kuò)增的引物,其中的一個(gè)引物標(biāo)記進(jìn)行生物素標(biāo)記,以質(zhì)粒為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,獲得特異長(zhǎng)度的生物素標(biāo)記的核酸序列,利用親和素磁珠進(jìn)行純化,最終制備長(zhǎng)度特異的單鏈寡核苷酸(非生物素標(biāo)記)。利用親和素磁珠法制備MLPA長(zhǎng)探針的方法如圖1。
結(jié)果:采用PCR方法結(jié)合親和素磁珠法制備可用于多重連接擴(kuò)增技術(shù)的長(zhǎng)探針能根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求制備任意長(zhǎng)度的長(zhǎng)探針,不僅大大降低了探針設(shè)計(jì)的難度,同時(shí)避免了噬菌體培養(yǎng)和雙酶切等耗時(shí)長(zhǎng)、成本高等復(fù)雜的操作過(guò)程,使得普通的實(shí)驗(yàn)室也能順利進(jìn)行MLPA檢測(cè)實(shí)驗(yàn)。
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