來自Genetech公司(已被羅氏制藥收購)生物信息學與計算機生物學部，以及  Complete  Genomics公司等處的研究人員通過比對肺部腫瘤和正常組織中的基因序列，發(fā)現(xiàn)了多個與肺癌相關(guān)的基因突變，這些癌基因的發(fā)現(xiàn)對于未來研究肺癌靶向治療，以及基因突變具有重要的意義。這一研究成果公布在《自然》(Nature)雜志上。  

　　文章的通訊作者是Genetech公司的張澤民(Zemin  Zhang，音譯)博士，其早年畢業(yè)于南開大學，之后獲得賓夕法尼亞州立大學博士學位，主要研究興趣是癌癥基因組學，其研究組利用計算機方法嘗試預(yù)測疾病基因突變。  

　　全球每年由于吸煙導(dǎo)致肺癌的病例數(shù)不勝數(shù)，在工業(yè)發(fā)達國家如美國等，肺癌的發(fā)病率占常見癌癥的首位，為第一位癌癥死亡原因。煙草中的致癌物如3，4-苯并芘、煙焦油等的致癌作用是一致公認的。  

　　2010年1月，英國劍橋大學韋爾科姆基金會桑格學院的研究人員利用大規(guī)模高通量測序技術(shù)，對小細胞肺癌細胞系：NCI-H209進行了測序分析，發(fā)現(xiàn)了與吸煙有關(guān)的突變。他們發(fā)現(xiàn)了22910個候選因子，其中還包括了134個編碼外顯子。  

　　而最新的這項研究發(fā)現(xiàn)了超過5萬個基因點突變，其中530個得到確認，它們當中392個在編碼區(qū)域，包括以前已知的變異，如KRAS“原致癌基  因”突變和放大。這些數(shù)據(jù)表明，遺傳上復(fù)雜的腫瘤可能包含很多部分冗余的突變，而且要識別復(fù)發(fā)性致癌“驅(qū)動突變”(driver  mutation)，將需要對很多尚未測序的樣本進行測序。  

　　完整基因組測序為包括肺癌在內(nèi)的若干種癌癥類型的突變譜提供了線索。在這篇文章中，研究人員從全基因組范圍內(nèi)來觀察突變差異，他們對一名煙齡超  過15年，平均每天吸煙25根的原發(fā)性肺部腫瘤患者進行分析，將這名患者的癌細胞和相鄰正常組織的完整序列進行了比較。發(fā)現(xiàn)了多達5萬個基因突變，這一數(shù)  目非常龐大，過去從未有研究發(fā)現(xiàn)如此多的基因突變。  

　　研究人員認為這可能和患者的煙齡有關(guān)，通過這一患者吸煙的數(shù)量和基因突變的比例來看，籠統(tǒng)來說就是每吸三根煙即可能產(chǎn)生一個基因突變。當然具體  的情況更為復(fù)雜，但是研究人員也指出，雖然人體的DNA修復(fù)機制能部分修復(fù)由于吸煙帶來的傷害，但是吸煙時間越長，這種機制功能就越差。  

　　除此之外，研究人員還在這5萬個基因中找到了392個在編碼區(qū)域的突變，包括以前已知的變異，如KRAS原致癌基因突變和放大。這些數(shù)據(jù)表明，遺傳上復(fù)雜的腫瘤可能包含很多部分冗余的突變。