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專家解析結(jié)合RNAi與測序技術(shù)研究癌癥

日期:2011-01-21 09:50:56

隨著新一代測序方法的迅猛發(fā)展,越來越多的科學(xué)家開始利用這一方便快捷的技術(shù)進(jìn)行深層次研究工作,并陸續(xù)獲得了許多重要的成果。

來自美國國家衛(wèi)生研究所下屬美國國立癌癥研究所的Louis M. Staudt教授是一位從事癌癥研究多年的科學(xué)家,其研究組曾發(fā)現(xiàn)了6種能預(yù)測淋巴瘤生存期的基因,還弄清楚了骨髓瘤中到底是什么控制骨髓瘤細(xì)胞的活性和擴(kuò)散。這些研究對于癌癥的治療與預(yù)防具有重要意義。

之前的研究通過分析人類淋巴瘤免疫球蛋白基因以及基因工程小鼠模型,了解了B細(xì)胞抗原受體(BCR)信號(hào)在淋巴瘤形成過程中的作用,但是科學(xué)家們還沒有找到這一受體如何導(dǎo)致人類淋巴瘤形成的遺傳與功能性證據(jù)。

在這篇文章中,研究人員發(fā)現(xiàn)了一種“慢運(yùn)動(dòng)”BCR信號(hào),這種信號(hào)對于維持彌漫大B細(xì)胞淋巴瘤(DLBCL)ABC亞型中細(xì)胞的存活具有重要作用。研究人員認(rèn)為這種“慢運(yùn)動(dòng)”BCR信號(hào)是ABC型彌漫大B細(xì)胞淋巴瘤的一種新發(fā)病機(jī)制,因此可以作為治療這一疾病的一種新策略和靶標(biāo)。

彌漫大B細(xì)胞淋巴瘤是成人非霍奇淋巴瘤中最常見的一種類型,大約占30-40%,多見于中老年人,中國40-50歲居多。在歐美國家,DLBCL 的發(fā)病率約占非霍奇金淋巴瘤(NHL)的 31%。中央電視臺(tái)著名播音員羅京就是因?yàn)檫@一疾病而離世的。

在這一研究工作中,研究人員不僅采用了RNAi干擾技術(shù),還通過Illumina的GAII測序儀進(jìn)行分析,這兩種方法的結(jié)合有助于研究工作的順利進(jìn)行。

Illumina的GAII測序技術(shù)能夠在單核苷酸水平對任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動(dòng)進(jìn)行檢測,在分析轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu)和表達(dá)水平的同時(shí),還能發(fā)現(xiàn)未知轉(zhuǎn)錄本和稀有轉(zhuǎn)錄本,精確地識(shí)別可變剪切位點(diǎn)以及cSNP(編碼序列單核苷酸多態(tài)性),提供全面的轉(zhuǎn)錄組信息。并且這一方法相對于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺(tái),RNA測序無需預(yù)先針對已知序列設(shè)計(jì)探針,即可對任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動(dòng)進(jìn)行檢測,提供更精確的數(shù)字化信號(hào),更高的檢測通量以及更廣泛的檢測范圍。