核酸與蛋白質(zhì)相互作用機(jī)理研究獲進(jìn)展
日期:2011-06-08 08:09:38
近期來(lái)自吉林大學(xué)的研究人員分別與清華大學(xué)和中科院等處的研究人員在高分子結(jié)晶態(tài)分子間相互作用和RNA與蛋白質(zhì)間相互作用研究方面取得重要進(jìn)展。所獲得的跨學(xué)科研究新成果公布在著名的國(guó)際期刊《美國(guó)化學(xué)會(huì)志》(J. Am. Chem. Soc.)上,獲得了Nature Materials等多個(gè)雜志的推薦。
參與領(lǐng)導(dǎo)相關(guān)研究的是吉林大學(xué)超分子結(jié)構(gòu)與材料國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室張文科教授,其早年畢業(yè)于吉林大學(xué)化學(xué)系,之后曾在德國(guó)慕尼黑大學(xué)應(yīng)用物理系,英國(guó)諾丁漢大學(xué)藥學(xué)院,英國(guó)諾丁漢大學(xué)生物分子科學(xué)中心進(jìn)行學(xué)習(xí)工作,涉及面廣,對(duì)于化學(xué),物理和生物學(xué)均有涉及,主要研究興趣包括利用分子生物學(xué)的手段和方法來(lái)合成與DNA復(fù)制有關(guān)的蛋白質(zhì),從單分子水平揭示復(fù)制過(guò)程發(fā)生的分子機(jī)理以及影響因素等多個(gè)方面。
近期其研究組與所蘇朝暉、王倩等合作,選取了煙草花葉病毒(TMV)為研究對(duì)象,利用單分子力譜方法研究了其基因組RNA與蛋白質(zhì)外殼之間的相互作用。
對(duì)于核酸與蛋白質(zhì)的相互作用機(jī)理的研究有利于實(shí)現(xiàn)對(duì)許多重要生命過(guò)程,如病毒感染及癌細(xì)胞生長(zhǎng)的調(diào)控。而研究生物體系中核酸與蛋白質(zhì)的相互作用對(duì)于準(zhǔn)確揭示它們之間的作用機(jī)理更具實(shí)際意義,但長(zhǎng)期以來(lái)由于難以找到適當(dāng)方法獲得直接測(cè)量,使得此研究進(jìn)展緩慢。
在這篇文章中,研究人員通過(guò)精細(xì)調(diào)控,將TMV顆粒以豎直方式固定在固體基片表面,然后利用AFM針尖與TMV內(nèi)部的RNA之間的物理吸附作用,將RNA基因組從其蛋白質(zhì)外殼中逐步提拉出來(lái),直接測(cè)得了RNA從其蛋白質(zhì)外殼上解組裝所需外力的大小。該解組裝力隨著拉伸速率的增加而增大,隨著pH值的增加而降低。研究還發(fā)現(xiàn),解組裝的RNA在適宜條件下可以重新結(jié)合到其蛋白質(zhì)外殼上。通過(guò)此研究他們將AFM單分子力譜方法拓展到復(fù)雜生物體系中核酸與蛋白質(zhì)相互作用的研究中,同時(shí)有望將該技術(shù)應(yīng)用到病毒感染機(jī)理的研究。
另外這一研究組還與清華大學(xué)張希教授合作,在國(guó)際上率先將原子力顯微鏡(AFM)的成像與單分子力譜巧妙地結(jié)合起來(lái),建立了從單分子水平研究高分子單晶中聚合物鏈之間相互作用的方法。以末端含巰基修飾的聚氧乙烯(PEO)單晶為模型體系,先利用自晶種法從其稀溶液中制備出PEO單晶;接著利用金納米粒子與巰基之間化學(xué)吸附標(biāo)記巰基末端,結(jié)合AFM成像來(lái)定位金納米粒子;再利用雙巰基修飾的AFM針尖與特定的金納米粒子接觸,通過(guò)化學(xué)吸附形成橋連。他們利用這種方法成功地實(shí)現(xiàn)了高分子鏈從其晶體中的單分子拉伸,定量測(cè)量了高分子鏈間相互作用的強(qiáng)度。該研究拓寬了單分子力譜方法在高分子凝聚態(tài)研究中的應(yīng)用,并可能用于單分子水平研究各種高分子的結(jié)晶行為。