創(chuàng)新的蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜應(yīng)用新技術(shù)

日期：2011-06-09 08:20:01

蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院及 AB SCIEX（全球領(lǐng)先的生命科學(xué)分析技術(shù)公司）的科學(xué)家匯聚一堂，公布一項基于質(zhì)譜應(yīng)用的新技術(shù)，利用此項技術(shù)，科學(xué)家有史以來首次可以獲得單獨蛋白質(zhì)組學(xué)樣品分析中每個肽段的數(shù)據(jù)。S

WATH 采集模式是一項重大技術(shù)突破，使用質(zhì)譜研究蛋白質(zhì)組學(xué)的用戶得以獲知整個蛋白質(zhì)組的完整數(shù)據(jù)。在與蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院 Ruedi Aebersold 博士進行的 MRMAtlas 合作的過程中，AB SCIEX 將開發(fā) MS/MS^A^LL 增強功能，使 AB SCIEX TripleTOF™ 5600 系統(tǒng)可以運行 SWATH 采集模式供全球科學(xué)家使用。有關(guān) SWATH 的詳情將于本周在丹佛召開的美國質(zhì)譜協(xié)會 (American Society of Mass Spectrometry, ASMS) 會議上公布。

SWATH 采集模式是 Aebersold 博士及其在蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院的團隊共同開發(fā)，為未來的蛋白質(zhì)組學(xué)研究提供的一種新的工作流程，該系統(tǒng)預(yù)計將產(chǎn)生令人震撼的蛋白質(zhì)組學(xué)新發(fā)現(xiàn)，并克服目前的質(zhì)譜平臺中因數(shù)據(jù)重復(fù)而給科學(xué)家?guī)淼睦Щ蟆１炯夹g(shù)關(guān)鍵優(yōu)勢在于其能提供樣品的完整定量與定性結(jié)果，該結(jié)果能按照提出的新假設(shè)經(jīng)電腦模擬進行回溯性的挖掘。

這一新技術(shù)是對 MRMAtlas 的完美補充，MRMAtlas 以質(zhì)譜技術(shù)為基礎(chǔ)，向大多數(shù)人類蛋白質(zhì)組提供研究平臺。全球科學(xué)家利用這一圖譜極大推進了生物標(biāo)志物研究、蛋白藥物開發(fā)、基礎(chǔ)生物及生物醫(yī)學(xué)研究。MRMAtlas 提供簡單及有效分析能力，探索蛋白質(zhì)組中前所未見的新領(lǐng)域。利用 TripleTOF 5600 系統(tǒng)的 SWATH 采集模式，將有更多科學(xué)家能使用 MRMAtlas。

現(xiàn)有高分辨率及軌道阱質(zhì)譜系統(tǒng)僅能定性檢測出復(fù)雜樣品中的蛋白質(zhì)子集，因為它們 MS/MS 獲取速度相對較慢，且為探知更準確的定量結(jié)果，常常會采用其他儀器再次進樣分析樣品。面對這些挑戰(zhàn)，AB SCIEX 開發(fā)出 SWATH 采集模式可以在單一進樣分析中同時對所有蛋白質(zhì)與肽進行定量與定性檢測。

與 Aebersold 博士及其團隊共同展開的這一活動還將繼續(xù)開發(fā)軟件處理方法，更好解析 MRMAtlas 的數(shù)據(jù)。SWATH 采集模式是 AB SCIEX 的 MS/MS^A^LL 技術(shù)的延伸，只能在 TripleTOF™ 5600 上完成，這是因為需要將極高的采集速度與定量能力、精確質(zhì)量及高分辨率整合在一起方可實現(xiàn)。MS/MS^A^LL 以前已成功用于脂質(zhì)組學(xué)及特種結(jié)構(gòu)表達?，F(xiàn)在進一步擴展此能力，MS/MS^A^LL 采用 SWATH 采集模式，極大提高了工作效率，因此可以結(jié)合 LC/MS --，顯著提高了質(zhì)譜技術(shù)。