2007年Science雜志就曾預(yù)測(cè)，人體微生物的研究可能成為國(guó)際科學(xué)家們的新熱點(diǎn)課題，時(shí)間過(guò)去四年，這一預(yù)測(cè)就得到證實(shí)，隨著MetaHIT（人類(lèi)腸道宏基因組計(jì)劃）計(jì)劃的開(kāi)展，腸道微生物與代謝疾病的研究步伐的加速，腸道微生物研究受到空前的重視。近期來(lái)自德國(guó)，比利時(shí)，法國(guó)，中國(guó)等多處學(xué)者組成的研究組在Nature雜志上發(fā)表了這一領(lǐng)域的最新研究成果。

這項(xiàng)研究通過(guò)解析歐洲四國(guó)（丹麥、法國(guó)、意大利和西班牙）的22名個(gè)體的糞便DNA樣品序列，將這些樣品的微生物組與之前的研究結(jié)果進(jìn)行了比對(duì)。之后研究人員又將研究延伸到丹麥的95名個(gè)體和美國(guó)的154名個(gè)體。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，根據(jù)腸道中大量出現(xiàn)的細(xì)菌種類(lèi)，所有數(shù)據(jù)可分成三類(lèi)，也就是說(shuō)，每個(gè)人都屬于這三種腸道類(lèi)型中的一種。

目前雖然研究人員還不清楚為什么不同人會(huì)有不同的腸道類(lèi)型，但是他們認(rèn)為這種差異可能在于人的免疫系統(tǒng)如何區(qū)分好細(xì)菌和壞細(xì)菌，或者與細(xì)胞釋放廢物的不同方式有關(guān)。

研究人員還發(fā)現(xiàn)老年人的腸道似乎有著更多分解碳水化合物的微生物基因，這可能是因?yàn)椋?dāng)年齡越來(lái)越大時(shí)，我們處理營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)可能沒(méi)那么高效，因此為了生存，細(xì)菌必須承擔(dān)起這項(xiàng)任務(wù)。除此之外研究人員還發(fā)現(xiàn)了一些與年齡、體重等性狀相關(guān)的細(xì)菌基因，這也可能成為肥胖或疾病的標(biāo)志物，這可能對(duì)診斷和預(yù)后有意義。

MetaHIT計(jì)劃是由歐盟第七框架計(jì)劃資助的子項(xiàng)目之一。該項(xiàng)目的合作伙伴包括了來(lái)自中國(guó)、美國(guó)、丹麥、法國(guó)、日本、西班牙、英國(guó)、芬蘭8個(gè)國(guó)家學(xué)術(shù)界和工業(yè)界的13個(gè)成員。值得關(guān)注的是深圳華大基因研究院前承擔(dān)MetaHIT計(jì)劃中的200多個(gè)歐洲人腸道微生物樣品的測(cè)序及后續(xù)生物信息分析工作——2010年MetaHIT國(guó)際會(huì)議就是由華大基因主辦。

這項(xiàng)計(jì)劃的目的是研究人類(lèi)腸道中的所有微生物群落，進(jìn)而了解人腸道中細(xì)菌的物種分布，最終為后續(xù)研究腸道微生物與人的肥胖、腸炎、糖尿病等疾病的關(guān)系提供非常重要的理論依據(jù)，達(dá)到預(yù)防和監(jiān)控的目的。MetaHIT計(jì)劃將極大地推動(dòng)宏基因組學(xué)研究的快速發(fā)展，使得大規(guī)模的宏基因組學(xué)研究相繼展開(kāi)，大量新的微生物種群和新的基因?qū)⒌靡园l(fā)現(xiàn)，對(duì)人類(lèi)健康將有積極的現(xiàn)實(shí)意義。

預(yù)計(jì)人類(lèi)腸道內(nèi)包括大約1000種細(xì)菌。在2010年，這一項(xiàng)目研究組收集了124個(gè)來(lái)自于歐洲人腸道菌群的樣本，采用了新一代大規(guī)模高通量的測(cè)序技術(shù)進(jìn)行深度測(cè)序，產(chǎn)出近6千億的堿基序列。經(jīng)過(guò)序列組裝和基因注釋分析，從中獲得330萬(wàn)個(gè)非冗余的人體腸道元基因組的參考基因，約是人自身基因的150倍。這個(gè)基因集中包含了絕大部分目前已知的人體腸道微生物基因，但更多的是目前未知微生物的基因。從這個(gè)基因集中可以估計(jì)人腸道中存在約1000到1150種細(xì)菌，平均每個(gè)體內(nèi)約含有160種優(yōu)勢(shì)菌種，并且這些細(xì)菌是絕大部分個(gè)體所共有的。

國(guó)際人類(lèi)微生物組協(xié)會(huì)計(jì)劃對(duì)1000種微生物進(jìn)行測(cè)序。這個(gè)計(jì)劃看似野心勃勃，但卻可能依然無(wú)法獲得所有與人類(lèi)健康相關(guān)微生物的基因多樣性?；蚪M完整性的最終檢驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)是隨機(jī)的宏基因測(cè)序結(jié)果是否能準(zhǔn)確地靶向某種細(xì)菌。不過(guò)隨著更多腸道細(xì)菌株的測(cè)序完成，研究人員未來(lái)將可以更準(zhǔn)確地判斷不同因素對(duì)腸道微生物的構(gòu)成造成了何種影響，繼而可判斷與疾病和健康的關(guān)系。