研究解析獼猴全基因組序列多態(tài)性
日期：2011-07-14 08:15:43
獼猴是人類的近親，也是在研究中最廣泛使用的非人靈長類模式動物。雖然獼猴在生物學(xué)和醫(yī)學(xué)方面的應(yīng)用已經(jīng)有很長的時間，但人們對獼猴基因組序列多態(tài)性的了解卻非常有限。
中國科學(xué)院昆明動物研究所宿兵實驗室（博士研究生張雁峰等）和華大基因合作，采用二代測序的方法對中國獼猴進行了全基因組序列分析。測序深度為獼猴基因組11.56倍的覆蓋率。通過和國外已測的印度獼猴基因組序列的比較，他們共發(fā)現(xiàn)了550萬個單核苷酸序列多態(tài)性位點（SNP），其中294萬個SNP是中國獼猴基因組中的雜合多態(tài)性，256萬個SNP是中國獼猴和印度獼猴間的差異位點。同時，他們還發(fā)現(xiàn)了12萬多個的基因組結(jié)構(gòu)變異（Structural variation, SV）。
這項工作是首次對獼猴全基因組序列多態(tài)性的解析，所報道的海量序列多態(tài)數(shù)據(jù)將為以獼猴為對象的生物學(xué)和臨床前醫(yī)學(xué)研究提供具有重要價值的數(shù)據(jù)庫。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表于基因組學(xué)的知名刊物《基因組生物學(xué)》（Genome Biology）。
