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揭示miRNA調(diào)控機制

日期:2011-07-18 08:23:30

近日,哈爾濱醫(yī)科大學的研究人員在生物信息學領域的世界頂級雜志《生物信息學簡訊》(Briefings in Bioinformatics)上發(fā)表了題為“解析人類miRNA(微小核苷酸)對子通路的調(diào)控影響”的科研論文,SCI影響因子高達9.283。 

領導這一研究的是哈爾濱醫(yī)科大學生物信息科學與技術學院院長、國家高技術研究發(fā)展計劃(863計劃)課題組負責人李霞教授。其多年來一直從事生物信息學領域的教學和科研工作,作為學術帶頭人,創(chuàng)建了哈醫(yī)大生物信息學學科,先后承擔科研課題30余項,在國內(nèi)外重要學術刊物和學術會議上發(fā)表學術論文120余篇。近年來,李霞教授致力于復雜疾病功能基因識別方法的研究在復雜疾病基因作圖的模式識別方法研究領域做出重要貢獻,論文“Gene mining: a novel …”曾受到了Nobel獎得主Rich Roberts博士的好評。

miRNA是一類單鏈的非編碼RNA分子,在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因的表達。miRNA參與許多重要的生物學過程,如發(fā)育、分化、增殖等,同時,越來越多的研究報道m(xù)iRNA與多種人類復雜疾病密切相關,如癌癥、糖尿病、心血管疾病等。

在先前的研究中李霞課題組發(fā)現(xiàn):某些疾病的發(fā)生并不是整個生物學通路異常所導致的,而更可能是通路的某個局部區(qū)域(子通路)發(fā)生了功能失調(diào)。此次,李霞教授帶領課題組首次在系統(tǒng)水平識別出了480個人類miRNA所調(diào)控的子通路,篩選出了miRNA協(xié)同調(diào)控的功能相關的子通路簇,并深入研究了癌癥等123種疾病相關的miRNA對子通路的調(diào)控特點。結果提示從協(xié)同的角度研究人類microRNA對子通路調(diào)控的影響不僅是系統(tǒng)解釋microRNA調(diào)控機理的一個重要突破點,而且對于研究microRNA在疾病發(fā)生、發(fā)展過程中發(fā)揮作用的機制具有重要意義。

該研究是研究人員首次從全局性的角度建立miRNA對子通路的調(diào)控關系,并對miRNA(尤其是疾病miRNA)的調(diào)控特點進行了深入分析。該成果不但有助于解析miRNA的調(diào)控機制,而且對于準確定位疾病基因具有重要的參考和幫助。

此外,為了將計算分析的成果應用到生物學實驗或臨床研究中,李霞教授的課題組還開發(fā)了方便、快捷的網(wǎng)絡分析平臺。生物醫(yī)學家只要選擇感興趣的miRNA,平臺就會提供包括該miRNA關聯(lián)的疾病、靶基因、子通路以及靶基因在子通路中的位置等信息,這些結果以可視化的通路形式給出,從而更直觀地指導進一步實驗的開展。