科學(xué)家們?yōu)榱四苌钊肓私馓禺愋曰虮磉_(dá)，發(fā)展了許多實(shí)驗(yàn)技術(shù)，比如芯片技術(shù)，PCR，高通量測(cè)序等，但是要想得到精確的結(jié)果，仍然依賴(lài)于實(shí)驗(yàn)操作人員對(duì)于技術(shù)掌握的熟練程度。而且隨著基因表達(dá)研究越來(lái)越多，為了確保公布的結(jié)果的精確性，對(duì)于相關(guān)分析也越來(lái)越嚴(yán)格。不過(guò)所幸目前也有了更多基因表達(dá)分析相關(guān)的產(chǎn)品，這些產(chǎn)品帶來(lái)的新技術(shù)也許能幫助我們解決難題。

非編碼RNA分析

近年來(lái)非編碼RNAs，microRNAs成為了研究熱點(diǎn)，不少研究成果表明miRNAs在基因表達(dá)分析中扮演了重要角色，這些小分子片段經(jīng)過(guò)蛋白行使功能，它們直接與mRNA相互作用，抑制翻譯?，F(xiàn)代生命科學(xué)表明，僅通過(guò)分析轉(zhuǎn)錄，基因表達(dá)，并不能告訴我們所有的事情。

著名的Life Technologies公司今年推出了一款新型的microRNA分析平臺(tái)：TaqMan OpenArray MicroRNA Panels，這一平臺(tái)能對(duì)每一樣本檢測(cè)數(shù)百種microRNA，分析樣品覆蓋700多個(gè)條人類(lèi)和嚙齒類(lèi)動(dòng)物（小鼠和大鼠），而且這一分析平臺(tái)需要的樣品少——只需低至100毫微克的總RNA，分析速度快——8小時(shí)工作日內(nèi)可以處理36個(gè)樣本（33nl的反應(yīng)體系，每個(gè)Panel可以處理3個(gè)樣本），因此是一種適合中高通量microRNA研究的選擇。

除此之外，上文提及的nCounter miRNA表達(dá)系統(tǒng)也可以用于非編碼RNA的分析，這一系統(tǒng)包括人類(lèi)，小鼠和大鼠的miRNAs分析平臺(tái)，可以在同一試管中定量分析mRNAs和miRNAs。

基因表達(dá)數(shù)據(jù)處理

基因表達(dá)實(shí)驗(yàn)分析中產(chǎn)生的數(shù)據(jù)越來(lái)越多，要分析這龐大的數(shù)據(jù)群無(wú)疑是一個(gè)挑戰(zhàn)，而且除了數(shù)據(jù)數(shù)量以外，從中整理出相關(guān)數(shù)據(jù)也令人頭疼，比如研究人員也許希望同時(shí)分析幾個(gè)相關(guān)因素?cái)?shù)據(jù)，或者排除地點(diǎn)，和時(shí)間的影響來(lái)分析樣品數(shù)據(jù)，而且研究人員還常常需要分析不同平臺(tái)獲得基因表達(dá)數(shù)據(jù)之間的相關(guān)性。

來(lái)自全球最大的統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件公司推出的JMP Genomics軟件是JMP家族的一員，JMP統(tǒng)計(jì)軟件能幫助研究人員將生命科學(xué)數(shù)據(jù)完全可視化，促進(jìn)高效、互動(dòng)的數(shù)據(jù)探索和分析。這一軟件系統(tǒng)可以應(yīng)用到從實(shí)驗(yàn)室工作臺(tái)到病床的全過(guò)程中，優(yōu)化研究和開(kāi)發(fā)周期，還可以分析藥物從臨床前到后期市場(chǎng)營(yíng)銷(xiāo)的的整個(gè)生命周期表現(xiàn)。

JMP Genomics應(yīng)用廣泛，可以連續(xù)分析伴隨有海量數(shù)據(jù)的芯片實(shí)驗(yàn)，以及高通量測(cè)序研究中產(chǎn)生的數(shù)據(jù)組，SAS的JMP生命科學(xué)產(chǎn)品部經(jīng)理Shannon Conners表示SAS將這些分析工具歸于特殊數(shù)據(jù)類(lèi)型，“比如像是RNA測(cè)序分析之類(lèi)的數(shù)據(jù)分析，都有簡(jiǎn)化的流程”，新出品的JMP Genomics5.1將帶來(lái)更多的方便。

另外作為測(cè)序領(lǐng)域的領(lǐng)先科技公司，Illumina也有針對(duì)基因表達(dá)分析的相關(guān)軟件，其GenomeStudio數(shù)據(jù)分析軟件可以用來(lái)查看和分析基因表達(dá)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)，GenomeStudio軟件中性能優(yōu)化的工具和用戶(hù)友好的圖形化界面讓研究人員能夠快速輕松地將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化成有意義的結(jié)果。

這些分析工具顯示了基因表達(dá)分析與其它方法結(jié)合的進(jìn)步，這些技術(shù)的結(jié)合將有助于基因表達(dá)分析越來(lái)越快，也越來(lái)越簡(jiǎn)單。