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Nat Methods:DNA/RNA分子定量新技術(shù)

日期:2011-11-23 08:37:37

近日來自瑞典醫(yī)科大學卡羅琳斯卡醫(yī)學院的研究人員開發(fā)了一種分子定量新方法,相關(guān)研究論文在線發(fā)表在1120日《自然方法》(Nature Methods)雜志上。

 

領(lǐng)導這一研究的是卡羅林斯卡研究院的生物化學和生物物理學家Sten Linnarsson和生命科學與營養(yǎng)學系Jussi Taipale教授。

 

DNARNA是細胞中遺傳信息的重要承載者和傳遞者,實現(xiàn)對不同種類的DNARNA分子的精確定量成為了分子生物學一項基礎(chǔ)任務(wù)。因此,改良這些分子檢測技術(shù)對了解正常細胞和癌細胞中的生理和病理機制具有非常重要的意義。

 

由于目前的技術(shù)尚無法直接對復合物中的少量個別分子進行檢測,研究人員常采用擴增技術(shù)來獲得大量拷貝分子以放大信號。然而這種擴增方法卻很難實現(xiàn)精確追蹤模板初始分子數(shù)。其原因在于相同分子擴增獲得的所有拷貝彼此無法區(qū)分,因而不能確定每個初始分子的具體拷貝次數(shù)。

 

在這篇文章中,研究人員開發(fā)出一種新方法對這些分子進行人工標記,使得生成的拷貝能夠很容易區(qū)分出它們的初始分子。隨后研究人員利用一種可并行讀取數(shù)百萬DNA片段的新型高通量測序儀高效完成了對這些分子的定量。目前采用的多種方法均只能檢測樣品間的相對差異,新技術(shù)原理非常的簡單,卻可實現(xiàn)對細胞樣品中的分子精確定量。

 

Jussi Taipale教授的研究團隊隨后利用這一技術(shù)完成了對細胞中數(shù)千種不同mRNA分子的同步定量檢測,檢測數(shù)據(jù)表明新技術(shù)顯示了比當前類似常用技術(shù)更高的準確性。高效準確的計數(shù)mRNA分子具有重要的意義,通過定量它們的豐度即可了解到靶細胞中的基因表達情況。Taipale實驗室長期從事細胞生長調(diào)控研究,他們希望能借助于這一技術(shù)來了解在正常及癌變等異常情況下細胞中的基因活性表達。

 

新技術(shù)在對少量細胞進行分子定量方面顯示了特別的優(yōu)勢,Sten Linnarsson計劃將其應(yīng)用到對單細胞的分子定量中去——是一個令人感到興奮且具有挑戰(zhàn)性的工作。此外,研究人員表示新技術(shù)的原理也可適用于改良其他重要的檢測技術(shù),幫助開發(fā)出更高精確度的基因組測序技術(shù)。

特別關(guān)注