對馬的一項遺傳分析提示，所有現(xiàn)代馬的共同的雌性祖先可能生活在13萬年到16萬年前之間。由于人類歷史上關(guān)于馬的馴化的考古學(xué)和遺傳學(xué)的證據(jù)并不完整，Antonio Torroni及其同事分析了來自亞洲、歐洲、中東和美洲的現(xiàn)代馬的83個線粒體基因組，這些基因組僅僅繼承自母馬。在這些基因組中，這組作者發(fā)現(xiàn)了18個主要的遺傳集群，稱為單倍群，每一個單倍群都是由具體的突變定義的。這組作者報告說，所有這些單倍群看上去都來自大約14萬年前的祖先母馬。與牛和羊等大約1萬年前僅僅在幾個地點起源于少數(shù)馴化動物的現(xiàn)代牲畜不同，現(xiàn)代馬的大量單倍群提示母馬的馴化發(fā)生在歐亞大陸的許多地方。這組作者說，現(xiàn)代馬的單倍群的分子分辨率如此之高的精確度可能有助于對保存完好的馬化石進行分類，重新評估包括純種馬在內(nèi)的現(xiàn)代馬品種的世系，并評估線粒體基因組對賽馬表現(xiàn)的影響。