沙眼衣原體全基因組測序完成
日期:2012-03-29 08:46:43
本月《自然—遺傳學》的一份報告公布了沙眼衣原體的全基因組序列。沙眼衣原體是一種人體病原體,除了能引發(fā)沙眼這種可致盲疾病,還能引發(fā)性傳播流行疾病。
Simon Harris和同事對53種沙眼衣原體進行了全基因組測序和對比。為保證臨床標本的多樣化,他們從1959年至2009年間發(fā)生的多種流行病中挑選出了這些病原體。利用測序數(shù)據(jù),他們?yōu)樵摬≡w建立了一套更精確的全基因組系統(tǒng)學研究,分析并重建了沙眼衣原體的進化史,這對流行病傳播監(jiān)測以及病原體種類構成和病株多樣性的鑒定具有潛在意義。
研究人員同時發(fā)現(xiàn),通過對ompA這種可對主要外膜蛋白編碼的基因進行分型后,所得到的沙眼衣原體單個基因傳統(tǒng)診斷結論,在病株分型和遺傳相關性推論方面具有一定局限性。他們建議對該基因組中更多的基因座進行分型,以保證病株分型能更精確。