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美國國立衛(wèi)生研究院“冷對”基因數(shù)據(jù)隱私新挑戰(zhàn)

日期:2012-04-16 09:03:08

本周發(fā)表的一篇極具“挑釁性”的論文提到,研究人員找到一個方法可以連接一個人的基因到某一公共研究數(shù)據(jù)庫里其匿名的基因數(shù)據(jù)上。但是,美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)作為最大的此類數(shù)據(jù)庫的擁有者之一,表示不打算采用任何新步驟預防某些人利用這種辦法破壞基因隱私。這與NIH四年前的反應形成鮮明對比,當時,一個相類似的研究促使它將基因數(shù)據(jù)從其公共網(wǎng)站中取了出來。

 

那時,NIH將來自于數(shù)百人的單核苷酸多態(tài)性(SNP)數(shù)據(jù)張貼在了網(wǎng)上,以為不會破壞隱私。但是,隨后有科學家在《公共科學圖書館—遺傳學》(PloS Genetics)上發(fā)表文章指出,如果他們有某個人的DNA樣本,他們可以在一個公共DNA數(shù)據(jù)庫中連接到該人的SNP結(jié)果。如此一來,NIH和維康基金會不得不將這些數(shù)據(jù)從公共網(wǎng)站上撤了下來?,F(xiàn)在,NIH只允許通過認證的研究者下載這些SNP數(shù)據(jù)。

 

對于特殊類型的基因數(shù)據(jù)而言,這種準入壁壘并不常見,例如通過研究組織樣本中的RNA水平分析測量基因活性。因為這類基因表達數(shù)據(jù)被認為不是起源于某個人,研究人員已經(jīng)定期存放RNA結(jié)果到公共數(shù)據(jù)庫中,例如,NIH的基因表達綜合(GEO)數(shù)據(jù)庫。

 

但是,紐約市西奈山醫(yī)學院的Eric Schadt和同事在《自然—遺傳學》(Nature Genetics)發(fā)表的論文提到,他們發(fā)現(xiàn)了生成基于個體的基因表達結(jié)果的個人SNP“主頁”,或一個DNA“條碼”的方法。這就意味著,原則上講,如果有人有一個儲存在GEO參與者的DNA樣本,他將能夠設計出一個SNP條碼,用它來與GEO樣品進行匹配,尋找參與者的生物數(shù)據(jù)。

 

盡管與2008PloS Genetics發(fā)表的論文相似,但是NIH此時并未憂慮。NIH的一份聲明提到,NIH認為不需要改變自己的數(shù)據(jù)共享模式。美國國家人類基因組研究所發(fā)言人Larry Thompson解釋道,Schadt團隊需要極為復雜的統(tǒng)計工具,并且這不是一個簡單的事情。Schadt則并不期望NIH采取新的數(shù)據(jù)訪問限制,而是希望強調(diào),事實上可能沒有方法能夠完全保證個人基因數(shù)據(jù)安全。