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諾獎(jiǎng)得主Cell特寫(xiě)文章:miRNA新角色

日期:2012-05-10 08:26:28

來(lái)自麻省理工,霍德華休斯醫(yī)學(xué)院的研究人員發(fā)表了題為“Roles for MicroRNAs in Conferring Robustness to Biological Processes”的綜述文章,探討了小分子RNAmiRNAs)如何應(yīng)對(duì)復(fù)雜波動(dòng)的外界環(huán)境,緩沖機(jī)體生物學(xué)網(wǎng)絡(luò)功能。這篇宏觀統(tǒng)籌文章公布在Cell雜志上,并作為前言特寫(xiě)文章推薦,目前文章免費(fèi)閱讀。

 

領(lǐng)銜撰寫(xiě)這篇文章的是1993年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)獲得者、美國(guó)麻省理工學(xué)院(MIT)教授、前美國(guó)總統(tǒng)科技顧問(wèn)Phillip A. Sharp教授,Sharp教授是分子生物學(xué)和生物化學(xué)領(lǐng)域的著名科學(xué)家,于1977年發(fā)現(xiàn)了真核基因中的RNA剪接現(xiàn)象,并因此與Richard J. Roberts共同獲得1993年諾貝爾獎(jiǎng)。目前,Sharp教授致力于對(duì)癌癥的系統(tǒng)生物學(xué)研究,包括癌癥相關(guān)基因表達(dá)的分子生物學(xué)研究和RNA剪接機(jī)理的研究。

 

面對(duì)環(huán)境和遺傳的波動(dòng)變化,生物系統(tǒng)采用了各種不同的機(jī)制來(lái)維持其功能。目前有越來(lái)越的證據(jù)表明,miRNAs作為一種基因表達(dá)轉(zhuǎn)錄后抑制因子,能通過(guò)加強(qiáng)轉(zhuǎn)錄過(guò)程,以及減少異常轉(zhuǎn)錄,從而幫助增強(qiáng)生物進(jìn)程的強(qiáng)健性(Robustness)。并且這種分子也參與了一些網(wǎng)絡(luò)作用,這有助于防止轉(zhuǎn)錄拷貝數(shù)量的隨即波動(dòng)。

 

所謂強(qiáng)健性是指生物體面對(duì)遺傳和環(huán)境變異所表現(xiàn)出來(lái)的表型相對(duì)不變的能力,這些能力活性對(duì)于機(jī)體正常發(fā)育,生理功能,死亡,以及進(jìn)化具有重要的影響,因此Sharp教授與另外一位研究人員共同撰文,探討了這些miRNAs促進(jìn)動(dòng)物系統(tǒng)正常功能方面的一些例子和規(guī)則。

 

MicroRNAs (miRNAs)最早是在上世紀(jì)90年代初,LeeWightman等通過(guò)在線蟲(chóng)中分析發(fā)育時(shí)間突變體首次發(fā)現(xiàn)。但直到2001年后,才出現(xiàn)了集中研究這些調(diào)控性RNAs的專(zhuān)門(mén)領(lǐng)域,隨后科學(xué)家們?cè)诰€蟲(chóng)、果蠅和哺乳動(dòng)物中鑒別出大量?jī)?nèi)源表達(dá)的小RNAs。在此后的10年里,miRNA生物學(xué)研究獲得了令人矚目的關(guān)注,取得了飛速的發(fā)展。

 

miRNAs最先被發(fā)現(xiàn)的功能之一是其在發(fā)育轉(zhuǎn)化中的幫助作用。來(lái)自全球的科學(xué)家們通過(guò)果蠅,魚(yú)類(lèi),小鼠中的基因表達(dá)分析,發(fā)現(xiàn)miRNAs及其靶標(biāo)常常會(huì)出現(xiàn)組織互斥RNA表達(dá),尤其是來(lái)自同一祖先的相鄰組織。這說(shuō)明miRNAs能通過(guò)抑制遺漏轉(zhuǎn)錄(leaky transcripts),加強(qiáng)轉(zhuǎn)錄的基因表達(dá)程序。

 

有趣的是這種模式不僅適用于轉(zhuǎn)錄,也適用于選擇性剪接,比如說(shuō)果蠅能在腸道,大腦和表皮上表達(dá)原肌球蛋白-1tropomyosin-1)的一種細(xì)胞質(zhì)亞型,但是肌肉中卻不會(huì)出現(xiàn),并且這種亞型會(huì)被肌肉特異性的miRNAmiR-1靶定。相比之下,三種肌肉表達(dá)的亞型卻缺乏miR-1結(jié)合位點(diǎn),而且這種特性保守性強(qiáng),在整個(gè)脊椎動(dòng)物中都有。因此這種能產(chǎn)生細(xì)胞質(zhì)腸道/大腦/表皮亞型,卻在肌肉細(xì)胞中缺失的錯(cuò)剪接事件,也許能通過(guò)miRNA介導(dǎo)的抑制作用糾正。

 

2009年,麻省理工的研究人員對(duì)斑馬魚(yú)胚胎進(jìn)行了細(xì)胞類(lèi)型敏感基因表達(dá)譜分析,發(fā)現(xiàn)這并不是一種鮮明的互斥模式,而是一種非關(guān)聯(lián)miRNAs和其靶標(biāo)重疊表達(dá)傾向,這說(shuō)明miRNAs并不只是通過(guò)轉(zhuǎn)錄調(diào)控加強(qiáng)了模式,而是具有更多主要的作用。事實(shí)上,在斑馬魚(yú)中,強(qiáng)轉(zhuǎn)錄,廣泛表達(dá)的肌動(dòng)蛋白轉(zhuǎn)錄能通過(guò)肌肉特異性miRNAs進(jìn)行空間調(diào)控。

 

作為緩沖劑,miRNAs能調(diào)控同一信號(hào)通路的激活因子和抑制因子,比如在斑馬魚(yú)中,miR-430既調(diào)控Nodal信號(hào)途徑中Nodal的同源基因Squint,也調(diào)控Squint的抑制因子Lefty。當(dāng)miR-430表達(dá)水平下降時(shí),Nodal信號(hào)的增強(qiáng)會(huì)因?yàn)樗囊种埔蜃颖磉_(dá)升高而受到制約。而當(dāng)miR-430基因缺失時(shí),斑馬魚(yú)胚胎對(duì)Nodal配體的很小的波動(dòng)也會(huì)非常敏感。因此,有些miRNAmiR-430一樣同時(shí)調(diào)控激活和抑制因子來(lái)降低它們的絕對(duì)濃度,調(diào)控它們的相對(duì)水平來(lái)維持最優(yōu)的信號(hào)效果,同時(shí)避免了意想不到的有害的信號(hào)波動(dòng)。