Science子刊:外顯子組測(cè)序個(gè)體化醫(yī)療應(yīng)用
日期:2012-06-18 07:53:57
在6月13日的《科學(xué)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)》(Science Translational Medicine)雜志上,由加州大學(xué)圣地亞哥醫(yī)學(xué)院的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)國(guó)際研究小組報(bào)告稱(chēng)新的外顯子組測(cè)序(exome sequencing)技術(shù)不僅成為了鑒別致病基因的一種有前景的方法,也可能改善診斷及指導(dǎo)個(gè)體化患者醫(yī)療護(hù)理。
在外顯子組測(cè)序中,研究人員選擇性地同時(shí)靶向和定位基因組的所有外顯子區(qū)域。蛋白質(zhì)是生物學(xué)的主力因子參與幾乎所有的細(xì)胞功能,肩負(fù)各種結(jié)構(gòu)或功能職責(zé)。而外顯子是基因中轉(zhuǎn)錄生成蛋白質(zhì)的關(guān)鍵性短DNA序列。
在加州大學(xué)圣地亞哥分校神經(jīng)科學(xué)和兒科教授、首席研究員Joseph G. Gleeson博士的帶領(lǐng)下,研究人員對(duì)118位確診患有特異神經(jīng)發(fā)育疾病的患者進(jìn)行了外顯子組測(cè)序。在每個(gè)病例中,他們疾病所有已知的遺傳原因先前均被排除。
并不奇怪的是,科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)外顯子測(cè)序新確定了許多的致病基因,包括確定EXOC8基因是一種累及發(fā)育小腦的Joubert綜合征的病因,GFM2是一種導(dǎo)致小型腦和小兒糖尿病的疾病的病因。
而更令研究人員驚訝地是,他們發(fā)現(xiàn)在大約10%的病例中,外顯子組測(cè)序?qū)е麓_定了一個(gè)已知的致病基因,提示某些患者的疾病診斷和治療將發(fā)生改變。
Gleeson 說(shuō):“最初,我們驚訝地發(fā)現(xiàn)一些已知引起了人類(lèi)疾病的基因突變,因?yàn)榛诨颊叩脑\斷我們此前排除了這些已知的病因。當(dāng)我們重新回到患者處解析曾經(jīng)發(fā)生的事情時(shí),我們確定在每個(gè)病例中,最初的診斷與基因診斷并不一致。這發(fā)生在大約10%我們研究的病例中,雖然患者是根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)臨床實(shí)踐來(lái)進(jìn)行診斷的?!?/SPAN>
研究人員發(fā)現(xiàn)每個(gè)病例的基因診斷是完全正確的,通過(guò)仔細(xì)查閱患者病歷,確定了最初的診斷是錯(cuò)誤的。“如果我們這些結(jié)果延伸到這些診所中所見(jiàn)的一般群體。我們可以推斷出通過(guò)先進(jìn)的遺傳檢測(cè)大量的患者的診斷和治療都有可能被修改。”
Gleeson說(shuō)這些不一致的原因是多方面的,并不反映醫(yī)學(xué)診斷的錯(cuò)誤——至少研究小組沒(méi)能發(fā)現(xiàn)。相反,他說(shuō)差異突顯了獲得特異診斷的固有困難,尤其是鑒于腦發(fā)育和功能的復(fù)雜性。
文章的第一作者、Gleeson實(shí)驗(yàn)室成員Tracy Dixon-Salazar博士說(shuō)這些研究結(jié)果提供了證明臨床外顯子組測(cè)序是可以用于診斷疾病的有價(jià)值的工具,尤其是對(duì)于那些預(yù)后不良、治療有限的神經(jīng)發(fā)育障礙患者。