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Your Good Partner in Biology Research

Nature頭條:這是一個神奇的網(wǎng)絡(luò)

日期:2012-06-26 08:16:24

在大科學(xué)項目清單中重點強調(diào)的一個項目,就是找到人類大腦的“布線圖”,這個包含有上千億個神經(jīng)細胞,百萬億個神經(jīng)連接的大型網(wǎng)絡(luò),調(diào)控著我們機體的各種動作,各個決策,以及喜怒哀樂。要了解這個神奇的大腦網(wǎng)絡(luò),第一步,我們需要完成完整小鼠大腦的圖譜。

 

來自冷泉港實驗室的研究人員完成并公布了小鼠大腦環(huán)路的詳細細節(jié),這第一批數(shù)據(jù)包含有500 terabytes,這個稱為小鼠大腦結(jié)構(gòu)工程(Mouse Brain Architecture Project,MBA)的項目計劃描述嚙齒類動物大腦整個分布情況,這是首個脊椎動物大腦環(huán)路圖譜。

 

“目前關(guān)于大腦環(huán)路的信息并不完整”,美國國家藥物濫用研究所遺傳學(xué)與分子神經(jīng)生物學(xué)專家Jonathan Pollock 說,“缺乏神經(jīng)環(huán)路的信息,使得科學(xué)團隊認識到需要構(gòu)建關(guān)于大腦微觀,中觀和宏觀尺度的圖譜。”

 

MBA項目填補一些研究的空白,比如美國國立衛(wèi)生研究院的人類連接組項目(Human Connectome Project),以及ALLEN Brain Connectivity Atlas。前者計劃在人類大腦功能的基礎(chǔ),分享有關(guān)人類大腦的結(jié)構(gòu)和功能連接的數(shù)據(jù)映射神經(jīng)通路,這一項目將使我們理解是什么使我們?nèi)祟惸軇?chuàng)造出重大進展,并會為未來在許多神經(jīng)和精神疾病的異常腦回路研究建立一個新階段。

 

而后者則是由Paul G. AllenJody Allen Patton共同投資興建的非盈利性質(zhì)的醫(yī)療機構(gòu)——腦科學(xué)Allen研究院進行的關(guān)于大腦連接的一項整體分析。

 

Pollock教授表示,由于小鼠一直以來都是人類遺傳學(xué)的一個重要模型,對于我們了解在一些疾病,比如阿爾茲海默,自閉癥,神經(jīng)分裂等方面提供了許多幫助。近年來科學(xué)家們聚焦于哺乳動物大腦,通過電子顯微等技術(shù),分析個體突觸,神經(jīng)元之間連接點等。但是這些方法對于分析整個小鼠大腦來說,并不實用。

 

冷泉港實驗室的研究人員采用4個注入示蹤劑來追蹤大腦環(huán)路,其中兩個是“經(jīng)典”的示蹤劑——霍亂毒素亞單位(choleratoxin subunit B),以及雙向神經(jīng)示蹤劑(biotinylated dextran amines),還有兩個是病毒示蹤劑:腺病毒群(adeno-associated virus),和經(jīng)修改的狂犬病毒。

 

這項研究獲得了小鼠大腦切片的高清晰度圖像,每張圖像大約都有十億像素。每個大腦大約有500張圖片,每張圖片拍攝的是20微米厚度的大腦組織光學(xué)成像結(jié)果。

 

除此之外,研究人員還在其中添加了公開的一些數(shù)據(jù),神經(jīng)科學(xué)家能通過http://mouse.brainarchitecture.org 獲取所有信息。這一網(wǎng)站采用的是“虛擬顯微”,來觀察大腦內(nèi)部,可以放大,顯示個體神經(jīng)元,以及神經(jīng)過程。研究人員可以采用不同的分辨率顯示器查看圖像。

 

領(lǐng)導(dǎo)這一項目的生物物理學(xué)家Partha Mitra表示,將與大家共享這些數(shù)據(jù),除此之外,其研究組還準備了一個教程,幫助一些不是這一領(lǐng)域的研究人員利用這一網(wǎng)站的資源。

 

在大腦作圖方面,2010年中國的科學(xué)家也獲得了突出的成果:研制了顯微光學(xué)切片層析成像系統(tǒng),從而能獲得了小鼠全腦高分辨率圖譜。這一研究成果公布在Science雜志上。

 

研究人員利用顯微光學(xué)切片層析成像系統(tǒng),對制備好的鼠腦為樣本,全自動連續(xù)242小時進行了數(shù)據(jù)采集,共獲得15380層像素分辨率為0.3×0.3微米的冠狀斷面圖像。同時,科研組利用高定位精度的三維移動平臺,及在切片中采用對先采取到的信息進行驗證分析的方法,對圖像準確定位和預(yù)處理,實現(xiàn)了突起水平的小鼠全腦結(jié)構(gòu)成像,獲得了一套來自同一只老鼠的全腦組織切片圖譜。這種介觀水平的小鼠全腦神經(jīng)解剖圖譜,為數(shù)字化鼠腦結(jié)構(gòu)和腦功能仿真研究提供了重要的基礎(chǔ)性實驗數(shù)據(jù)參考。

 

特別關(guān)注