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Blood:首次外周T細(xì)胞淋巴瘤全基因組測序

日期:2012-08-03 08:19:14

美國Mayo診所的研究人員完成了世界上首個外周T細(xì)胞淋巴瘤全基因組測序分析,外周T細(xì)胞淋巴瘤是一種高度侵襲性的免疫系統(tǒng)癌癥,這項(xiàng)研究揭開了其背后鮮為人知的遺傳學(xué)致病因素。

 

Mayo診所病理學(xué)家Andrew Feldman博士在Illumina GAIIx, HiSeq測序平臺上,對外周T細(xì)胞淋巴瘤進(jìn)行了全基因組測序分析,在多發(fā)性外周T細(xì)胞淋巴瘤中發(fā)現(xiàn)了13個基因組異常。其中的5個與重要的p53蛋白的合成及其活性有關(guān),由于p53蛋白在細(xì)胞周期中的核心作用及其抑癌能力,它常被稱為“基因組的保衛(wèi)者”。

 

該文章提前發(fā)表在81Blood雜志的網(wǎng)絡(luò)版上。

 

“每當(dāng)我診斷出一例外周T細(xì)胞淋巴瘤,我都會想到有三分之二的患者會被這一疾病擊敗,”Feldman博士說?!斑@種感覺非常糟糕,而我希望這項(xiàng)研究能改變這一狀況?!?/SPAN>

 

外周T細(xì)胞淋巴瘤PTCL是成熟T淋巴細(xì)胞惡性腫瘤,約有12%non-Hodgkins淋巴瘤是外周T細(xì)胞淋巴瘤,這種疾病的而死亡率非常高。在診斷出該疾病后,只有少于35%的患者能存活超過五年。由于人們?nèi)鄙賹ν庵?/SPAN>T細(xì)胞淋巴瘤遺傳學(xué)和分子發(fā)病機(jī)理的了解,使該疾病治療缺少分子靶標(biāo),治療效果也受到限制。

 

研究人員利用第二代測序技術(shù)和生物信息學(xué)工具,對16位外周T細(xì)胞淋巴瘤患者的組織樣本以及6個外周T細(xì)胞淋巴瘤細(xì)胞系進(jìn)行了全基因組測序分析。研究人員發(fā)現(xiàn)的關(guān)鍵性外周T細(xì)胞淋巴瘤基因組異常如下:

 

發(fā)現(xiàn)了13個反復(fù)發(fā)生的染色體重拍

 

發(fā)現(xiàn)了13個重排事件中有5個涉及具有重要的抑癌功能的p53基因

 

發(fā)現(xiàn)了涉及TP53同源基因和TP63的新重排事件,新發(fā)現(xiàn)的TP63重排編碼了一個融合蛋白,一個抑制p53通路的p63異構(gòu)體。這些重排事件都與患者的存活期短有關(guān)

 

發(fā)現(xiàn)了4個染色體內(nèi)的突變,包括已知的ALKDUSP22-IRF4異位

 

該研究為特定亞型的外周T細(xì)胞淋巴瘤提供了新的生物學(xué)診斷標(biāo)記(機(jī)體系統(tǒng)中的化學(xué)或遺傳學(xué)線索),并能幫助人們開發(fā)新的治療手段。以前要取得這些進(jìn)展并不容易,因?yàn)樵陲@微鏡下顯得很相似的淋巴瘤可能實(shí)際上大為不同,使得人們難以預(yù)測其對治療的反應(yīng)。此外,科學(xué)家和醫(yī)生們對于外周T細(xì)胞淋巴瘤發(fā)育和增殖機(jī)制的了解也相當(dāng)有限。

 

T細(xì)胞淋巴瘤最常見的類型被稱作是‘無特殊說明’這基本就是個廢紙簍似的診斷,這是因?yàn)槲覀儗Σ煌?/SPAN>T細(xì)胞淋巴瘤亞型的特異性遺傳學(xué)突變還了解的不夠,而不同的亞型需要不同的治療方式,”Dr. Feldman說。

 

Dr. Feldman的這項(xiàng)研究將有助于改善T細(xì)胞淋巴瘤的診斷,并幫助開發(fā)有針對性的治療方法。

 

特別關(guān)注