Cell頭條:奇妙的基因組“手風(fēng)琴”
日期:2012-08-21 08:24:00
單個(gè)基因的復(fù)制就能對抗宿主抗病毒防御,這聽起來好像不太真實(shí),但是痘病毒(poxviruses)在病毒演化過程中,通過一個(gè)基因的快速多拷貝擴(kuò)增,就能適應(yīng)并對抗宿主的抗病毒防御,這被稱為“基因組手風(fēng)琴”(Genomic Accordions),利用這個(gè)機(jī)制,痘病毒實(shí)現(xiàn)了突變率雖然低,但能快速進(jìn)化,這一由Fred Hutchinson癌癥研究中心完成的成果公布在Cell雜志上。
同期Cell也以“Poxvirus Use a Gene Accordion to Tune Out Host Defenses”為題推薦了這項(xiàng)研究成果,專家們指出,“基因擴(kuò)增,突變和刪除的多步驟過程,幫助痘病毒克服了宿主的抗病毒防御,這種機(jī)制能遺傳適應(yīng)性,將能在許多生物學(xué)事件進(jìn)行廣泛的應(yīng)用?!?/SPAN>
痘病毒(Poxviridae)是哺乳動(dòng)物的最大及最復(fù)雜的病毒,包含兩個(gè)亞科痘病毒脊索亞科 (Chordopoxvirinae)、痘病毒昆蟲亞科 (Entomopoxvirinae),其中最有名的就是天花病毒,天花的病原Variola病毒為Orthopoxvirus屬,這一病毒曾經(jīng)摧殘全人類,目前已被撲滅,但是最近常被認(rèn)為是一種有可能之再新興之疾病。其它的痘病毒如駱駝痘(camel pox)及ectromelia造成低等動(dòng)物的皮膚發(fā)疹。
痘病毒屬于雙鏈DNA病毒,與RNA病毒不同,雙鏈DNA病毒雖然突變率低,但是卻能快速進(jìn)化,從而發(fā)展出對人類和動(dòng)物攻擊性強(qiáng)的病毒變種。那么痘病毒是采用了什么機(jī)制,實(shí)現(xiàn)這一進(jìn)化的呢?
在這篇文章中,研究人員揭開了這個(gè)謎底,他們指出了這種大型的雙鏈DNA是通過一種特殊機(jī)制,從而能從宿主的免疫系統(tǒng)中逃脫出來,并變得具有耐藥性的,這種機(jī)制不僅有助于理解傳染疾病在動(dòng)物和人類傳播的機(jī)制,而且也可以用于分析其它生物學(xué)現(xiàn)象。
文章的通訊作者為Fred Hutchinson癌癥研究中心的Harmit S. Malik,以及Nels C. Elde,或者表示,“痘病毒中有許多編碼基因,能幫助它們對抗宿主免疫防御,促進(jìn)傳染”,“盡管有充足的證據(jù)表明,痘病毒基因組發(fā)生了適應(yīng)性變化,克服了宿主防御,但是我們?nèi)匀徊恢肋@一機(jī)制的具體內(nèi)容?!?/SPAN>
為了弄清楚這一機(jī)制,研究人員細(xì)胞培養(yǎng)了牛痘病毒,這是之前用在天花疫苗中的一種病毒,研究人員希望通過分析這種病毒的變化,來模擬病毒適應(yīng)性進(jìn)化。
之前的研究證明一種宿主防御蛋白:PKR(蛋白激酶R)是痘病毒傳染的主要屏障,為此痘病毒通過進(jìn)化出兩個(gè)編碼基因:K3L和E3L,來對抗這一屏障。研究人員分析了牛痘病毒在敲除E3L基因后如何演化,從而在有人類PKR存在的前提下成功復(fù)制。
“戲劇性的是,這個(gè)‘弱化’后病毒的快速系列變化,導(dǎo)致其病毒株在人類細(xì)胞中能快速的復(fù)制”,Malik說。研究人員進(jìn)一步分析了這種演化模式,發(fā)現(xiàn)病毒快速擊敗PKR,是通過選擇性的增加了基因組中K3L基因的拷貝數(shù)。
Malik將這種快速適應(yīng)比喻成樂器手風(fēng)琴的風(fēng)箱在拉動(dòng)的時(shí)候出現(xiàn)的膨脹,“當(dāng)K3L拷貝數(shù)持續(xù)增多,K3L蛋白的表達(dá)也快速擴(kuò)張,從而抑制了免疫系統(tǒng)的應(yīng)答”,他說。這表明能快速擴(kuò)充其基因組的病毒,具有比其它未能擴(kuò)充的病毒,更具即時(shí)進(jìn)化能力。
而且這一手風(fēng)琴的比喻也有進(jìn)一步的含義——除了觀察到E3L缺失病毒株的快速基因表達(dá),研究人員還發(fā)現(xiàn)在獲得了一個(gè)適應(yīng)性突變后,病毒又交換了一個(gè)有益的突變,形成更小的基因組印跡。
“我們的研究表明盡管痘病毒基因表達(dá)并不長,但是能進(jìn)行有效適應(yīng)性進(jìn)化,這有助于它們在免疫系統(tǒng),和藥理環(huán)境中存活下來”,Malik說,“找到這種擴(kuò)增的方式,也許能為我們提供對抗相關(guān)病原體更有效的抗病毒策略?!?/SPAN>