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Your Good Partner in Biology Research

Nature子刊:強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)手打造“英特爾”蛋白芯片

日期:2012-08-22 08:10:18

斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院和英特爾公司強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)手,在常用于計(jì)算機(jī)微處理器的硅芯片上直接合成了疾病相關(guān)的高通量多肽陣列,并展示了這一新技術(shù)的強(qiáng)大應(yīng)用潛力。在這項(xiàng)研究中,半導(dǎo)體制作工序生產(chǎn)的芯片被成功用于狼瘡患者的診斷,文章發(fā)表在八月十九日Nature Medicine雜志網(wǎng)絡(luò)版上。

 

利用這一技術(shù),研究人員將能夠快速深入的分析蛋白間相互作用,從而加快藥物研發(fā)。盡管這一新技術(shù)主要著眼于研究領(lǐng)域,但它同時也具有強(qiáng)大的疾病診斷潛力,還能夠幫助醫(yī)生針對特定患者選擇最有效的治療藥物。

 

“在對患者進(jìn)行臨床診斷時,也許能很快確診他們患有關(guān)節(jié)炎,但卻無法快速判斷他們所患的關(guān)節(jié)炎屬于哪一種類型,”斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)副教授Paul (P.J.) Utz說,現(xiàn)有方法需要數(shù)天甚至一個星期來進(jìn)行進(jìn)一步確診?!岸F(xiàn)在我們能夠同時檢測數(shù)千種蛋白的相互作用,整合海量信息來診斷疾病類型和疾病的嚴(yán)重程度。也許在不久的將來,這一技術(shù)就能成為臨床的常規(guī)檢查項(xiàng)目?!?/SPAN>

 

細(xì)胞中蛋白質(zhì)的復(fù)雜相互作用形成了多種多樣的生命機(jī)制,控制著細(xì)胞生長、免疫反應(yīng)甚至導(dǎo)致疾病。要了解蛋白之間轉(zhuǎn)瞬即逝的微觀作用及其生物學(xué)效果,并不容易也相當(dāng)耗時。

 

為此,Intel的研究人員采用制造半導(dǎo)體的光刻法,直接在硅芯片上成功合成了多肽陣列,并將其稱為Intel芯片。隨后斯坦福的研究人員利用這一技術(shù),對數(shù)千種蛋白的相互作用進(jìn)行了同時分析,以診斷疾病、評估治療甚至研發(fā)更有效的新藥。

 

研究人員希望能夠最終將這種硅芯片整合到半導(dǎo)體回路,形成用于臨床診斷等過程的微型計(jì)算機(jī),為患者量身定做最合適有效的治療方案。

 

這一新技術(shù)與DNA微陣列相似,是將多肽以一定的模式附著在固相基質(zhì)上,檢測時用細(xì)胞或血液的蛋白溶液與之反應(yīng),通過熒光信號來指示這一過程中的蛋白相互作用。不同的是,Intel研究人員并不是用機(jī)械臂將先合成好的蛋白點(diǎn)到陣列上,而是直接在硅芯片上進(jìn)行蛋白合成。

 

這種技術(shù)具有多種優(yōu)勢,硅對蛋白的粘性比玻璃小,可以省去一些避免多肽隨機(jī)結(jié)合基質(zhì)的步驟。而且不同多肽可以在硅芯片上排列得更緊密,更有效利用空間。此外,硅與玻璃不同,硅不發(fā)熒光能使信號檢測更容易。

 

斯坦福大學(xué)的研究人員檢測了該芯片診斷狼瘡患者的能力。狼瘡是一種嚴(yán)重的自體免疫疾病,患者體內(nèi)會產(chǎn)生抗體攻擊細(xì)胞中的組蛋白。

 

“狼瘡具有很高的多樣性,有些類型特別嚴(yán)重,”Utz說。“約半數(shù)患者需要加強(qiáng)治療。我們希望試驗(yàn)該芯片能否診斷出這類患者?!?/SPAN>

 

研究人員利用針對組蛋白2B末端21個氨基酸的芯片,來檢測患者體內(nèi)針對組蛋白2B的抗體。這一技術(shù)成功鑒別出了那些病情特別嚴(yán)重的患者(他們的體內(nèi)針對組蛋白2B的抗體表達(dá)水平很高),并且確定了各種抗體的特異性結(jié)合區(qū)域。這種詳細(xì)的信息能夠幫助研究人員了解疾病中發(fā)生異常的生物學(xué)過程,并有助于人們利用藥物破壞、增強(qiáng)或者模仿細(xì)胞內(nèi)的生物學(xué)反應(yīng)來進(jìn)行更有效的治療。

 

目前研究人員正在使用這一新技術(shù)開發(fā)強(qiáng)力流感疫苗,同時也在嘗試將蛋白三維折疊整合到該技術(shù)中以加強(qiáng)其分析蛋白相互作用的能力。

 

特別關(guān)注