Cell新文章:癌癥全基因組測(cè)序
日期:2012-09-14 08:13:55
根據(jù)華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院的一項(xiàng)新研究,具有吸煙史的肺癌患者相比于不吸煙的肺癌患者腫瘤中的遺傳突變要多10倍。這一研究在線發(fā)表在9月13日的《細(xì)胞》(Cell)雜志上。
論文的資深作者、華盛頓大學(xué)基因組研究所主任Richard K. Wilson 說(shuō):“吸煙者基因組具有比不吸煙的肺癌患者基因組更多的突變,我們中沒(méi)有人對(duì)此感到驚訝。但令人吃驚的是看到10倍以上的突變,它強(qiáng)化了舊的訊息——不要抽煙。”
總的來(lái)說(shuō),該分析確定了所有17名非小細(xì)胞肺癌患者中大約3,700個(gè)突變。12名患者有吸煙史,5人沒(méi)有。在每位從不吸煙的患者體內(nèi),研究人員發(fā)現(xiàn)至少有一個(gè)突變基因可用當(dāng)前市場(chǎng)上用于其他疾病或通過(guò)臨床試驗(yàn)可獲得的藥物靶向。在所有患者中,他們確定了54種與現(xiàn)有藥物相關(guān)的突變基因。
文章的第一作者、腫瘤學(xué)家Ramaswamy Govindan在華盛頓大學(xué)和巴恩斯-猶太醫(yī)院的塞特癌癥中心從事患者治療工作。Govindan說(shuō):“這些藥物實(shí)際上是否會(huì)在具有這些DNA改變的患者體內(nèi)起作用還需要加以研究。而像這樣的論文為了解發(fā)生的事件打開(kāi)了新的圖景?,F(xiàn)在我們需要做的就是深入研究,并通過(guò)研究來(lái)了解這些突變?nèi)绾我鸷痛龠M(jìn)了癌癥,以及如何能夠靶向它們進(jìn)行治療?!?/SPAN>
肺癌可分為兩種類(lèi)型小細(xì)胞肺癌和非小細(xì)胞肺癌,后者約占85%的病例。非小細(xì)胞肺癌進(jìn)一步分為三類(lèi)。當(dāng)前的分析包括了其中兩種:16名患者患有肺腺癌,一名患者大細(xì)胞癌。
Govindan和 Wilson還涉及了一個(gè)更大型的基因組研究,178名患者患有第三種類(lèi)型鱗狀細(xì)胞癌,相關(guān)論文報(bào)道在《自然》(Nature)雜志上。該研究是癌癥基因組圖譜計(jì)劃(The Cancer Genome Atlas project)的一個(gè)部分,該計(jì)劃的目的旨在描述常見(jiàn)癌癥的遺傳學(xué)。
Govindan說(shuō):“在未來(lái)一年左右的時(shí)間內(nèi),我們將研究近1000個(gè)肺癌患者的基因組。因此我們正在朝著正確的方向——向著側(cè)重于患者癌癥的特異分子生物學(xué)的未來(lái)臨床試驗(yàn)前進(jìn)?!?/SPAN>
事實(shí)上,根據(jù)例證不同癌癥類(lèi)型中常見(jiàn)突變新的遺傳研究,Wilson推測(cè)該領(lǐng)域或許可以達(dá)到醫(yī)生能夠基于突變基因而非受累器官標(biāo)記和治療腫瘤的高點(diǎn)。例如,在突變基因驅(qū)動(dòng)腫瘤生成后他們或許可以將之稱為“EGFR癌癥”而非“肺癌”。EGFR突變被發(fā)現(xiàn)存在于多種癌癥中,包括肺癌、結(jié)腸癌和乳腺癌。
Wilson說(shuō)這種標(biāo)記是有關(guān)系的,因?yàn)槿缃瘾@得批準(zhǔn)的靶向治療是以患病器官或組織為基礎(chǔ)。例如赫賽汀(Herceptin®)本質(zhì)上是一種乳腺癌藥物。但他看到肺癌轉(zhuǎn)折具有Herceptin可以靶向的相同的基因突變。
他說(shuō):“例如,如果基因組測(cè)序揭示一位肺癌患者具有一種突變,已知其對(duì)一種在具有相同遺傳改變的乳腺腫瘤中起作用的藥物敏感,你或許會(huì)想將這一藥物用于這些肺癌患者,理論上是作為臨床試驗(yàn)的一部分。在今后幾年,我們希望更多的基于腫瘤改變的遺傳構(gòu)成而非起源組織來(lái)治療癌癥。”