超級細菌的暴發(fā)困擾著英國劍橋市新生兒特殊護理病房的醫(yī)護人員。在基因測序的幫助下，去年以來持續(xù)數(shù)月的困境終于結(jié)束了。刊登在近期出版的《柳葉刀—傳染病》上的一份研究報告稱，科學(xué)家首次測序了病原體基因，以便積極控制進行中的超級細菌暴發(fā)。

英國劍橋大學(xué)的臨床微生物學(xué)家Sharon Peacock及其同事被卷入了這場超級細菌暴發(fā)的困境中。當(dāng)時，幾天內(nèi)，當(dāng)?shù)氐牧_西醫(yī)院嬰兒24小時特別監(jiān)護室中的三個嬰兒的耐甲氧西林金黃色葡萄球菌（MRSA）測試相繼呈陽性。

從這三個嬰兒身上分離出的細菌對一類抗生素表現(xiàn)出耐藥性，研究人員表示，這指向一個公共細菌源。病房被徹底地清掃干凈，醫(yī)護人員希望超級細菌噩夢能夠就此結(jié)束。

不過，出于科學(xué)家的好奇心，Peacock研究小組繼續(xù)調(diào)查了這三個病例是否與之前的半年里羅西醫(yī)院出現(xiàn)的一系列MRSA感染有聯(lián)系。

實驗室測試結(jié)果顯示，那時至少還有另外8名兒童感染了相似耐藥性的MRSA菌株。但是，有數(shù)周沒有出現(xiàn)感染病例，這又顯示超級細菌的感染并不是簡單地從該病房的嬰兒傳染到嬰兒。

為了將一連串事件串聯(lián)起來，Peacock研究小組開始對取自該醫(yī)院的這種MRSA菌株以及收集自其他醫(yī)院的成年患者的相似的菌株的基因進行測序?；蚪M測序結(jié)果顯示，嬰兒病房的菌株與其他疑似病例的菌株相吻合。

不過，羅西醫(yī)院的細菌暴發(fā)并沒有結(jié)束。該病房殺菌數(shù)天后，又有一個嬰兒的MRSA檢測結(jié)果呈陽性。

不斷的MRSA傳染，讓Peacock和羅西醫(yī)院流行病學(xué)家們?nèi)缗R大敵。確定暴發(fā)菌株基因序列后，他們開始從嬰兒病房的154個工作人員中尋找暴發(fā)的菌株。其中一人的相關(guān)檢測結(jié)果呈陽性，盡管還沒有出現(xiàn)任何癥狀。

“我們將會將這個人隔離出感染鏈，以便有效地預(yù)防持續(xù)暴發(fā)。” Peacock說。

進一步的監(jiān)查還在這些成年人之中發(fā)現(xiàn)了另外的傳染病，這些人還包括從自己孩子身上接觸過MRSA的父母。一共有14個患者——6個嬰兒和8個成人——出現(xiàn)嚴(yán)重感染，亟須治療。最后一個確診案例發(fā)生在大暴發(fā)一年之后，病人是一位父親，他從配偶那里接觸了MRSA。值得慶幸的是，沒有人死亡。

這里，基因測序提供了明晰的線索，這是其他方法難以做到的，該論文的合作者、英國維康信托基金會桑格研究所微生物學(xué)家Julian Parkhill表示。

基因測序能夠揭示細菌暴發(fā)過程中發(fā)生的一系列小規(guī)模的基因突變，幫助流行病學(xué)家編寫一個進化樹，并追蹤暴發(fā)的源頭。進化分析顯示，這名受感染的雇員很可能是從該病房的一個患病嬰兒那里感染了MRSA。