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Nature:解析核小體的重塑機(jī)制

日期:2013-05-27 09:13:34

在細(xì)胞核中,基因組DNA緊緊包裹在核小體上形成染色質(zhì),但基因在如此緊密的包裝中是無(wú)法表達(dá)的?,F(xiàn)在德國(guó)慕尼黑大學(xué)LMU的研究團(tuán)隊(duì),揭示了局部釋放核小體DNA的分子機(jī)制,正是這一機(jī)制使染色體DNA得以轉(zhuǎn)錄。文章發(fā)表在本期的Nature雜志上。

 

高等生物的細(xì)胞核負(fù)責(zé)儲(chǔ)存基因組DNA,這些DNA環(huán)繞著由四種組蛋白組成的八聚體,形成碟狀的核小體結(jié)構(gòu)?;蚪MDNA以這樣的形式包裝成為染色質(zhì),使DNA受到良好的保護(hù)。但在這種緊密包裝的狀態(tài)下,介導(dǎo)DNA轉(zhuǎn)錄、修復(fù)和復(fù)制的酶難以接觸到DNA,也就無(wú)法執(zhí)行其正常功能。

 

包括組蛋白分子伴侶在內(nèi)的核小體重塑因子,負(fù)責(zé)令染色質(zhì)保持動(dòng)態(tài),以便進(jìn)行DNA轉(zhuǎn)錄等程序。這些因子能夠局部修飾核小體結(jié)構(gòu),與組蛋白亞基相互作用,甚至能將緊密包裝的DNA從核小體上解開(kāi)。

 

FACT復(fù)合體就是一種保守的組蛋白分子伴侶,是細(xì)胞分裂和DNA修復(fù)所必須的因子。FACT復(fù)合體能夠識(shí)別核小體,并在DNA轉(zhuǎn)錄、復(fù)制和修復(fù)過(guò)程中確保染色質(zhì)的完整性。FACT能特異性地與H2A-H2B組蛋白二聚體相互作用,這種二聚體是核小體標(biāo)準(zhǔn)結(jié)構(gòu)的一部分。

 

FACT識(shí)別H2AH2B二聚體的能力,是其多種功能的核心?!叭欢两裎覀冞€不了解這些組蛋白的識(shí)別機(jī)制,也不清楚FACTH2A-H2B相互作用對(duì)其功能有何影響,”LMUAndreas Ladurner教授說(shuō)?!耙虼耍覀冃枰私?/SPAN>FACT識(shí)別核小體時(shí)的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。”

 

Ladurner及其同事首先分析了FACT 復(fù)合體上與H2A-H2B結(jié)合的區(qū)域(Spt16M)。“這為我們提供了FACT與組蛋白相互作用的一些線索,但這樣的信息還不足以揭示核小體的識(shí)別機(jī)制,”文章的第一作者Maria Hondele說(shuō)?!坝谑?,我們又通過(guò)高分辨率的X射線晶體技術(shù),分析了FACT與組蛋白二聚體結(jié)合時(shí)的結(jié)構(gòu)?!?/SPAN>

 

晶體結(jié)構(gòu)顯示,FACT的結(jié)合阻斷了組蛋白二聚體上的一個(gè)關(guān)鍵位點(diǎn),該位點(diǎn)與DNA的親和力很高。研究人員指出,Spt16M區(qū)域與組蛋白相互作用,使FACT逐漸侵入核小體,阻斷組蛋白二聚體與DNA的接觸。在此基礎(chǔ)上,FACT使部分核小體發(fā)生重塑,增強(qiáng)了“核小體呼吸”現(xiàn)象,使局部DNA從核小體上釋放出來(lái),允許基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄?!芭c傳統(tǒng)觀點(diǎn)不同的是,上述機(jī)制并不需要將DNA從核小體上完全解開(kāi),而是允許轉(zhuǎn)錄機(jī)器通過(guò)核小體,”Ladurner說(shuō)。研究人員指出,正是借助上述機(jī)制,細(xì)胞核中的染色體裝配才得以實(shí)現(xiàn)動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié)。