Nature新文章:解碼姥鯊基因組
日期:2014-01-10 09:05:29
一個(gè)國際研究人員小組對姥鯊(elephant shark)的基因組進(jìn)行了測序和分析。將其與人類和其他脊椎動(dòng)物的基因組進(jìn)行比較,揭示出了為何鯊魚的骨架主要是由軟骨構(gòu)成,而不像人類的骨架一樣是由骨骼構(gòu)成,以及鯊魚的免疫系統(tǒng)相比人類要簡單得多的原因。Byrappa Venkatesh和他的同事們將這些研究結(jié)果發(fā)表在最新一期的《自然》(Nature)雜志上。
通過對免疫系統(tǒng)進(jìn)行分析,研究人員意外地發(fā)現(xiàn)鯊魚似乎沒有稱之為輔助性T淋巴細(xì)胞(T-helper lymphocyte)的特殊細(xì)胞類型,直到現(xiàn)在人們都認(rèn)為在脊椎動(dòng)物中輔助性T淋巴細(xì)胞對抵御病毒/細(xì)菌感染及預(yù)防糖尿病和風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎等自身免疫反應(yīng)起至關(guān)重要的作用。
盡管鯊魚免疫系統(tǒng)的構(gòu)造看似原始,但它卻顯示強(qiáng)大的免疫防御能力且長壽。論文的共同作者、德國馬克思普朗克免疫生物學(xué)和表觀遺傳學(xué)研究所所長Thomas Boehm說:“姥鯊免疫系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)與哺乳動(dòng)物有很大的不同。很明顯,沒有這種特殊的細(xì)胞類型鯊魚也能夠有效地應(yīng)對各種類型的感染。這表明,自然可以為同樣的問題提供不同的解決方案。”
當(dāng)艾滋病患者體內(nèi)的輔助性T細(xì)胞遭到破壞時(shí),他們會(huì)死于病毒和細(xì)菌感染。直到現(xiàn)在,人們都認(rèn)為這些細(xì)胞對于免疫系統(tǒng)至關(guān)重要。新研究結(jié)果挑戰(zhàn)了人們長期以來的認(rèn)知,為開發(fā)出非直觀的策略來調(diào)節(jié)人類免疫功能開啟了一條從所未有的途徑。
研究人員還調(diào)查了包括姥鯊在內(nèi)的軟骨魚類不能夠像人類和其他的硬骨脊椎動(dòng)物一樣用骨骼來替代軟骨的原因?;蚪M分析結(jié)果闡明了鯊魚缺少存在于所有硬骨脊椎動(dòng)物中的一個(gè)基因家族,這一基因家族對于骨骼形成至關(guān)重要。當(dāng)研究人員在斑馬魚一類的硬骨魚中失活這些基因時(shí),發(fā)現(xiàn)不會(huì)發(fā)生鈣化。這一研究結(jié)果強(qiáng)有力地表明了,所研究的這一基因家族有可能是更好地了解諸如骨質(zhì)疏松癥等骨疾病的一個(gè)起點(diǎn)。
此外,研究還揭示了姥鯊基因組是所有脊椎動(dòng)物中進(jìn)化最慢的基因組。姥鯊甚至打敗了近期研究證實(shí)進(jìn)化極其緩慢的、被稱之為“活化石”的腔棘魚。因此,姥鯊有可能是很久以前滅絕的所有有頜脊椎動(dòng)物祖先的最佳代表。
包括鯊魚、鰩魚和銀鮫在內(nèi)的軟骨魚類,是現(xiàn)存最古老的有頜脊椎動(dòng)物群,其是在大約4.5億前與硬骨脊椎動(dòng)物分歧開來。姥鯊是一種棲息在沿澳大利亞南部和新西蘭的大陸架,水深為200-500米的溫帶水域。在大約1000個(gè)軟骨魚類物種中,選擇姥鯊作為模型是因?yàn)樗幕蚪M相對緊湊,只有人類基因組的三分之一大小。