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PNAS解析甲基化與重復(fù)基因

日期:2014-04-09 09:11:06

 

活細(xì)胞偶爾會在正常的復(fù)制過程中產(chǎn)生基因的額外拷貝。在漫長的生命發(fā)展史中,這些看起來多余的基因成為了適應(yīng)性和多樣性的來源,推動著生命的進(jìn)化?,F(xiàn)在,科學(xué)家們揭示了這些重復(fù)基因躲避自然選擇,并在基因組中留存下來的分子機制,這一過程正是現(xiàn)代生命形成的基礎(chǔ)。

 

研究人員發(fā)現(xiàn),DNA甲基化可以保護(hù)重復(fù)基因,使其不會因為自然選擇而淘汰。這樣它們才能夠在漫長的進(jìn)化過程中,發(fā)展出新的細(xì)胞功能。

 

“我們首次向人們明確展示,DNA甲基化與重復(fù)基因的演化有關(guān),”喬治亞理工學(xué)院的副教授Soojin Yi說。這項研究于四月七日發(fā)表在美國國家科學(xué)院院刊PNAS雜志上。

 

人類基因組中的基因至少有一半都是重復(fù)基因。這些重復(fù)基因不僅多余,還有可能損害細(xì)胞。由于絕大多數(shù)重復(fù)基因會高速累積突變,因此這些額外的基因拷貝很容易在自然選擇之下慢慢失活甚至丟失。

 

研究團(tuán)隊發(fā)現(xiàn),一些重復(fù)基因形成后不久,其調(diào)控區(qū)域就會被添上甲基化基團(tuán),阻止這些基因啟動。這樣的甲基化修飾可以保護(hù)這些基因免于自然選擇,使其能夠長期留在基因組中,最終被進(jìn)化賦予新的功能。研究顯示,一些年輕的重復(fù)基因,幾乎在形成之后就立刻被甲基化所沉默。

 

“我們的研究指出,新形成的重復(fù)基因甲基化水平更高,”Yi說。

 

研究人員發(fā)現(xiàn),在重復(fù)基因的調(diào)控區(qū)域,DNA甲基化的平均水平與進(jìn)化時間呈顯著的負(fù)相關(guān)。也就是說,越年輕的重復(fù)基因,擁有越高水平的DNA甲基化。

 

此外,大多數(shù)重復(fù)基因?qū)Γ?/span>duplicate gene pairs)中的甲基化分布,在十種人類組織中相當(dāng)一致,即甲基化水平高的那個重復(fù)基因在不同組織中始終保持更高水平的甲基化。“對于我們所檢測的組織而言,重復(fù)基因?qū)χ械募谆植枷喈?dāng)一致,”Keller說。

 

研究人員將人類基因組中的每個基因與其它序列進(jìn)行比較,構(gòu)建了包括所有人類重復(fù)基因的數(shù)據(jù)集。隨后,他們在十種不同的人類組織中進(jìn)行了DNA甲基化的檢測,并通過計算機模型分析了DNA甲基化與重復(fù)基因之間的關(guān)聯(lián)。

 

對于人類的大腦來說,重復(fù)基因?qū)τ诮M織的進(jìn)化特別重要。下一步,研究人員將深入解析表觀遺傳學(xué)修飾與大腦進(jìn)化有何聯(lián)系。

 

特別關(guān)注