PNAS解析CRISPR的DNA編輯機制
日期:2014-05-27 09:25:37
一個國際科學(xué)家小組促使我們朝著更深層次地了解一些酶“編輯”基因的機制邁出了重要一步,從而為糾正患者的遺傳疾病鋪平了道路。
來自布里斯托大學(xué)和立陶宛生物技術(shù)研究院的研究人員觀察了,一種叫做CRISPR的酶結(jié)合和改變DNA結(jié)構(gòu)的過程。
發(fā)表在《美國國家科學(xué)院院刊》(PNAS)上的這些研究結(jié)果,為最終利用這些基因組編輯工具來糾正人類遺傳疾病提供了至關(guān)重要的一塊拼圖。
CRISPR酶最初發(fā)現(xiàn)于上世紀80年代,是細菌和古細菌為了抵御病毒和質(zhì)粒的不斷攻擊而演化而來的一種獲得性免疫防御機制。近期科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)其中一種CRISPR酶——Cas9可用于編輯人類的基因組。
通過精心設(shè)計,這些酶可以靶向30億DNA分子堿基對中的堿基組合。這相當(dāng)于在23卷的百科全書中糾正一個拼錯的單詞。
為了實現(xiàn)這種大海撈針,CRISPR酶利用了RNA分子。靶向過程要求CRISPR酶分開DNA鏈,將這一RNA插入到稱作為“R-環(huán)”(R-loop)的序列特異性結(jié)構(gòu)中。
該研究小組利用特別改裝的顯微鏡測試了R-環(huán)模型,在顯微鏡中單個DNA分子在磁場中被拉伸。通過改變DNA上的切向力,研究人員可以直接觀察單個CRISPR酶介導(dǎo)的R-環(huán)形成事件。
這使得他們揭示出了這一過程中從前隱藏的一些步驟,并探查了DNA堿基序列的影響。
布里斯托大學(xué)生物化學(xué)院Mark Szczelkun教授說:“利用這些令人興奮的基因組編輯工具存在的一個重大挑戰(zhàn)是,要確保只靶向基因組中的特異位點。”
“我們的單分子檢測促成更深入地了解了DNA序列對于R-環(huán)形成的影響。在未來這將幫助合理地重新設(shè)計CRISPR酶來提高它們的精確度,將脫靶效應(yīng)降至最少。如果我們想要最終將這些工具應(yīng)用于糾正患者的遺傳疾病這將是至關(guān)重要的。