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Cell重大成果:最大規(guī)模癌癥基因組研究

日期:2014-08-08 09:06:59

 

來(lái)自美國(guó)加州的消息,癌癥基因組圖譜研究(Cancer Genome Atlas,TCGA)項(xiàng)目組公布了一項(xiàng)癌癥基因組最大規(guī)模研究結(jié)果,研究人員在多個(gè)基因組技術(shù)平臺(tái)上分析了超過(guò)3500個(gè)腫瘤,從中發(fā)現(xiàn)了一種能區(qū)分癌癥的新方法。

 

這一同領(lǐng)域最大規(guī)模的研究成果公布在87日的Cell雜志上,領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是加州大學(xué)圣克魯茲分校Buck研究所Christopher Benz Christina Yau。

 

2007年,美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院NIH宣布進(jìn)行為期兩年、總值340萬(wàn)美元的癌癥基因組圖譜研究計(jì)劃(Cancer Genome Atlas pilot program),這一計(jì)劃目標(biāo)是“測(cè)試一種大規(guī)模、系統(tǒng)性分析癌細(xì)胞基因組變化的方法的可行性”,為檢測(cè)、治療、預(yù)防癌癥提供基因組信息。

 

在過(guò)去的幾年里,這一項(xiàng)目陸續(xù)獲得了一些研究成果,而在最新這項(xiàng)研究中,研究人員采用6種不同的TCGA“平臺(tái)技術(shù)(platform technologies)”,分析了12種不同腫瘤類型樣品的DNA,RNA和蛋白,希望能從中發(fā)現(xiàn)不同類型的腫瘤如何相互區(qū)分。

 

研究結(jié)果表明相對(duì)于癌癥起源的組織類型,如乳房腎臟、膀胱等,相同癌癥起源的細(xì)胞類型具有更多分子和遺傳上的相似性。

 

文章的通訊作者Benz指出,我們組織中大部分是由許多不同類型的上皮細(xì)胞和非上皮細(xì)胞組成,“這項(xiàng)顛覆性的基因組研究不僅挑戰(zhàn)了基于組織類型的現(xiàn)有癌癥分類系統(tǒng),而且還提供了能用于進(jìn)一步研究的大量新數(shù)據(jù)來(lái)源,以及能用于區(qū)分每種新描述癌癥類型的分子特征整體列表,”Benz說(shuō),“比如說(shuō)膀胱癌能重新被分成幾種不同的癌癥類型,每一種都具有不同的臨床表征,這就有助于解釋對(duì)看似相同的癌癥類型進(jìn)行相同的全身療法治療,為什么患者往往反應(yīng)截然不同”。

 

這一研究組發(fā)現(xiàn)在十個(gè)癌癥患者中至少有一個(gè)能通過(guò)這種新系統(tǒng)分類到不同的癌癥類型中,而且Benz認(rèn)為如果他們下一輪進(jìn)行更多的樣品,和腫瘤類型的分析,將會(huì)有更多的腫瘤需要重新分類,他預(yù)計(jì)下一輪將進(jìn)行超過(guò)20種不同腫瘤類型的分析。

 

“考慮到這種多平臺(tái)類型基因組分析的潛力,我們還只是分析了冰山的一角。未來(lái)可能還有多達(dá)30% 50%的癌癥需要被重新歸類”。

 

在這項(xiàng)研究中,最引人注目的發(fā)現(xiàn)就是膀胱癌和乳腺癌方面的成果,至少有三個(gè)不同亞型的膀胱癌需要重新分類:一種是無(wú)法與肺腺癌區(qū)分開來(lái)的亞型,一種是與起源自頭部,頸部和肺部的鱗狀上皮細(xì)胞癌很相似的亞型。

 

這項(xiàng)研究也指出和證實(shí)了乳腺癌類型中已知的差異,而且還揭示出了新的令人驚訝的發(fā)現(xiàn)——基底樣乳腺癌實(shí)際上是一類新癌癥類型。

 

基底樣乳腺癌Basal-like breast cancers)通常稱為三陰性乳腺癌(triple-negative breast cancer),是一種特別具有侵襲性,并致命的癌癥。“即使這些基底樣癌癥出現(xiàn)在乳腺中,但在分子水平上它們與卵巢癌和鱗狀上皮細(xì)胞起源的癌癥更為相似,”Yau說(shuō)。

 

Benz認(rèn)為這一研究將能被用于臨床試驗(yàn)設(shè)計(jì),尤其是希望能通過(guò)腫瘤基因組重分類,尋找新的治療方法的患者,“雖然需要后續(xù)的研究來(lái)驗(yàn)證,并完善這一新提出的癌癥分類系統(tǒng),但是這項(xiàng)研究最終將能為個(gè)性化癌癥醫(yī)療時(shí)代的到來(lái),奠定基礎(chǔ)生物學(xué)基礎(chǔ)。”