NEJM:基因組分析解析一種高危白血病亞型
日期:2014-09-12 09:14:27
最近,美國(guó)圣裘德兒童研究醫(yī)院進(jìn)行的一項(xiàng)多機(jī)構(gòu)研究表明,在患有最常見急性淋巴細(xì)胞白血病(ALL)的年輕人當(dāng)中,有超過四分之一的人為一種預(yù)后不良的高危亞型,這種白血病亞型的患者,可能從廣泛用于其他成年人更常見白血病治療的藥物獲益。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在最近的《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》(The New England Journal of Medicine)。
ALL是最常見的兒童癌癥。本研究主要集中在一種ALL亞型,稱為費(fèi)城染色體樣ALL(Ph-like ALL)。在2009年,圣裘德科學(xué)家與兒童腫瘤學(xué)組織(COG)合作,首次在兒童中描述了Ph-like ALL亞型。本研究發(fā)現(xiàn),Ph-like ALL的患病率隨著年齡增長(zhǎng)而升高,這種亞型與預(yù)后不良有關(guān)。該研究對(duì)1725名1到39歲之間最常見ALL患者(涉及稱為B細(xì)胞的白血細(xì)胞,因此稱為B-ALL),進(jìn)行了詳細(xì)的基因組分析。
研究人員還使用下一代測(cè)序,來確定引起Ph-like ALL的遺傳學(xué)改變,包括一些以前與癌癥沒有關(guān)聯(lián)的基因。結(jié)果強(qiáng)調(diào)了Ph-like ALL的遺傳多樣性,但也表明,這些遺傳學(xué)改變可影響數(shù)量有限的生物信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。這些通路可調(diào)節(jié)基因控制細(xì)胞的生長(zhǎng)和增殖,在癌癥中這些細(xì)胞是被破壞的。
這些研究結(jié)果,結(jié)合圣裘德兒童研究醫(yī)院和其他結(jié)構(gòu)以前的工作,為確定酪氨酸激酶抑制劑(TKIs)是否能幫助改善患者預(yù)后的臨床試驗(yàn),奠定了基礎(chǔ)。解決這些問題的一項(xiàng)全國(guó)性研究,預(yù)計(jì)在今年晚些時(shí)候或2015年初開始。通過靶定激酶,TKIs能夠比化療藥物更準(zhǔn)確地殺死癌細(xì)胞。
本文通訊作者、圣裘德兒童研究醫(yī)院病理學(xué)系成員Charles Mullighan博士指出:“我們發(fā)現(xiàn),Ph-like ALL是跨越各種年齡階段的一種常見疾病,我們確定了新的基因組變化,集中在易受酪氨酸激酶抑制劑治療影響的少量信號(hào)通路。這些研究結(jié)果,為有助于改變患者(不論其年齡)預(yù)后的臨床試驗(yàn),起了帶頭示范作用。”
TKIs,包括像dasatnib和imatinib這樣的藥物,被廣泛用于治療成人更常見的其他白血病類型。這些藥物也被用于少數(shù)Ph-like ALL患者。本研究報(bào)道了8名此類疾病患者的經(jīng)歷,包括7名兒童,他們?cè)诓煌尼t(yī)療中心接受治療。這些患者雖然接受了化療,但白血病仍然持續(xù)。當(dāng)把TKI添加到治療方案當(dāng)中之后,每名患者都出現(xiàn)了戲劇性的好轉(zhuǎn)。有5名患者仍然停留緩解期,具有檢測(cè)不到的腫瘤。
本文通訊作者、科羅拉多大學(xué)醫(yī)學(xué)院兒科教授、COG ALL 委員會(huì)主席Stephen P. Hunger博士稱:“這些結(jié)果非常令人興奮,為我們?cè)谏贁?shù)ALL兒童和青少年中開展臨床試驗(yàn)、檢測(cè)TKIs加化療的治療效果,鋪平了道路。”COG和圣裘德的研究人員計(jì)劃?rùn)z測(cè)800名每年都參與COG ALL臨床試驗(yàn)的兒童,以發(fā)現(xiàn)哪些人會(huì)從這種治療方法受益。這項(xiàng)臨床試驗(yàn)預(yù)計(jì)將在今年或2015年初開放。
Ph-like ALL被認(rèn)為是一種Philadelphia (Ph)染色體重排,它與ALL的一種不同亞型有關(guān)。Ph陽性和Ph樣ALL亞型都有相似的基因表達(dá)模式,但是Ph-like ALL患者缺乏BCR和ABL1基因的融合——這是Ph-positive ALL的一個(gè)特征。
在這項(xiàng)研究中,患有標(biāo)準(zhǔn)風(fēng)險(xiǎn)B-ALL的1到9歲兒童中,10%為Ph-like ALL。在21到39歲的患者當(dāng)中,這個(gè)百分比隨著年齡的增長(zhǎng)而上升。目前一項(xiàng)工作正在確定老年人當(dāng)中的發(fā)病率。
不管他們的年齡多大,與其他B-ALL患者相比,Ph-like ALL患者在疾病發(fā)現(xiàn)5年后都較少可能會(huì)健康活著。兒童、青少年和年輕成年Ph-like ALL患者的總體存活率是62%,而相同年齡的其他B-ALL患者則是91%。Ph-like ALL患者的無白血病存活率約為47%,而其他患者則為83%。
為了尋找引起Ph-like ALL的遺傳變化,研究人員對(duì)42名患者進(jìn)行了全基因組測(cè)序和額外測(cè)序,其中包括來自136名患者白血病細(xì)胞的RNA。研究人員發(fā)現(xiàn),91%的Ph-like ALL患者有染色體重排或其他的遺傳改變,可激活細(xì)胞因子受體或激酶信號(hào)。圣裘德研究人員開發(fā)出一種稱為CICERO的分析工具,對(duì)于遺傳變化的確定起著關(guān)鍵作用。激酶是充當(dāng)細(xì)胞中開關(guān)的酶。細(xì)胞因子受體可調(diào)節(jié)細(xì)胞如何響應(yīng)稱為細(xì)胞因子的生長(zhǎng)因子。
圣裘德博士后研究人員Kathryn Roberts博士稱:“我們發(fā)現(xiàn)了Ph-like ALL的幾個(gè)新亞型,它們的特點(diǎn)是,細(xì)胞因子受體或激酶基因發(fā)生了改變。”她和圣裘德計(jì)算生物學(xué)系的研究科學(xué)家Yongjin Li博士,是該論文的共同第一作者。
有證明表明,幾種新發(fā)現(xiàn)的Ph-like ALL亞型,易受TKIs及其他靶向治療的影響。例如,約12%的患者有ABL1、ABL2、CSF1R和PDGFRB重組基因,眾所周知它們都對(duì)dasatnib和相關(guān)TKIs有反應(yīng)。
其他許多Ph-like ALL患者有JAK2、EPOR重排基因和其他基因,可通過藥物ruxolitinib靶定。Ruxolitinib藥物被批準(zhǔn)用于骨髓障礙治療,研究人員正在研究將其用于治療各種癌癥。
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