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日期:2020-05-08 15:14:52
SARS-CoV-2是一種正鏈RNA病毒,可引起人類嚴重的呼吸綜合癥。產(chǎn)生的冠狀病毒?。–OVID-19)的爆發(fā)已成為嚴重的全球性流行病,截止2020年5月7日,全球累計感染確診人數(shù)已超過380萬,死亡人數(shù)已超過26萬。SARS-CoV-2的基因組與SARS-CoV的基因組具有約80%的同一性,與蝙蝠冠狀病毒BatCoV RaTG13約有96%的同一性。
對于S蛋白與ACE2之間的關(guān)系,西湖大學(xué)特聘研究員陶亮用了一個更加形象的比喻:如果把人體想象成一間房屋,病毒是入侵者,那么ACE2就是這間房屋的“門把手”。S蛋白抓住了它,從而打開人體的大門,病毒得以長驅(qū)直入。
冠狀病毒基因組依次編碼刺突蛋白(Spike protein)、包膜蛋白(Envelope protein)、膜蛋白(Membrane protein)和核衣殼蛋白(Nucleocapsid)。
2019-nCoV-Structure
SARS-CoV-2通過識別人類宿主的ACE2蛋白從而進入細胞的,尤其是S蛋白結(jié)構(gòu)域的細胞受體結(jié)合區(qū)(Receptor bindingdomain,RBD)直接參與了宿主受體的識別,該區(qū)域的氨基酸變異會導(dǎo)致病毒的種屬嗜性和感染特性的變化。
RBD與ACE2相互作用,通過膜融合進入靶細胞,啟動病毒生命周期。并且承擔病毒與宿主細胞膜受體結(jié)合及膜融合功能,是宿主中和抗體的重要作用位點以及疫苗設(shè)計的關(guān)鍵靶點。
2020年2月19日,美國德克薩斯大學(xué)奧斯汀分校Jason S. McLellan研究組在Science雜志正式發(fā)表了題為 “Cryo-EM Structure of the 2019-nCoV Spike in the PrefusionConformation”的文章(2月15日在預(yù)印版平臺bioRxiv發(fā)布),利用冷凍電鏡技術(shù)分析了新型冠狀病毒表面S蛋白的近原子結(jié)構(gòu)。另外作者們通過生物物理以及結(jié)構(gòu)方面的證據(jù)發(fā)現(xiàn),SARS-CoV-2的S蛋白結(jié)合人體ACE2的親和力要遠高于SARS-CoV的S蛋白,解釋了新型冠狀病毒傳染性之強的主要原因。
RBD-ACE2-B0AT1 復(fù)合物與冠狀病毒S蛋白的結(jié)構(gòu)比較,二者通過RBD結(jié)構(gòu)域錨定在一起。左側(cè)為2019新型冠狀病毒,右側(cè)為SARS病毒 (來源:https://science.sciencemag.org/content/early/2020/02/19/science.abb2507)
2020年2月20日,中國科學(xué)院微生物研究所在線共享了2019新型冠狀病毒蛋白(S蛋白)受體結(jié)合區(qū)域(RBD)和人受體ACE2復(fù)合物2.5埃分辨率晶體結(jié)構(gòu),揭示了S蛋白與受體ACE2在原子層面相互作用。
(國家病原微生物資源庫(中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所)
編號:NMDCS0000001,http://nmdc.cn/nCoV)。
2020年3月30日,國際頂尖學(xué)術(shù)期刊 Nature 雜志以 Accelerated Article Preview 方式在線發(fā)表了題為“Structure of theSARS-CoV-2 spike receptor-binding domain bound to the ACE2 receptor”的研究論文(2月20日已在生命科學(xué)論文預(yù)印本網(wǎng)站 bioRxiv 上發(fā)布)。清華大學(xué)生命學(xué)院王新泉課題組和醫(yī)學(xué)院張林琦課題組緊密合作,利用X射線衍射技術(shù),解析了新型冠狀病毒(2019-nCoV)表面刺突糖蛋白受體結(jié)合區(qū)(receptor-bindingdomain, RBD)與人受體ACE2蛋白復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu),準確定位出新冠病毒RBD和受體ACE2的相互作用位點,闡明了新冠病毒刺突糖蛋白介導(dǎo)細胞侵染的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)及分子機制,從而為治療性抗體藥物開發(fā)以及疫苗的設(shè)計奠定了堅實的基礎(chǔ)。
新冠病毒刺突蛋白 RBD 與受體 ACE2 復(fù)合物的高分辨率結(jié)構(gòu) (來源:https://www.nature.com/articles/s41586- 020 - 2180 - 5)
由于S蛋白的必不可少的功能,它代表了抗體介導(dǎo)的中和靶標,并且預(yù)融合S結(jié)構(gòu)的表征將提供原子水平的信息,以指導(dǎo)疫苗的設(shè)計和開發(fā)。
雖然我們對于新冠病毒的揭秘可能只是冰山一角,也許研究成果的另一個意義在于,我們的相關(guān)研究人員可以在此基礎(chǔ)上去構(gòu)建不同的模型,進而展開具有針對性的研究,判斷什么樣的突變可能會進一步提高S蛋白與ACE2的相互作用,從而設(shè)計針對S蛋白或者ACE2蛋白的藥物和抗體;又或者設(shè)計小分子破壞它們之間的相互作用。而這些都為藥物設(shè)計和檢測手段開發(fā)提供了堅實的基礎(chǔ)。
Spike RBD 蛋白產(chǎn)品(活性驗證) Recombinant Human Novel Coronavirus Spike glycoprotein(S), partial(CSB-YP3324GMY1) 種屬:SARS-CoV-2 來源:Yeast 純度:Greater than 90% asdetermined by SDS-PAGE 標簽信息:N-terminal 6xHis-sumostar-tagged (Tris-Glycine gel) Discontinuous SDS-PAGE (reduced) with 5% enrichment gel and 15% separation gel.
Predicted band size: 38.2 kDa
Observed band size:
(a) 68 kDa before EndoH Digestion
(b) 38 kDa after EndoH Digestion
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