最新生物學(xué)信息圖表標(biāo)準(zhǔn)發(fā)布
日期:2010-09-21 13:30:27
標(biāo)準(zhǔn)化的圖表,做為一種視覺(jué)語(yǔ)言,被廣泛應(yīng)用于多個(gè)學(xué)科領(lǐng)域。使用標(biāo)準(zhǔn)圖表法傳達(dá)復(fù)雜信息,表意清晰、易于理解。但在圖表信息占據(jù)重要地位的生物學(xué)領(lǐng)域,卻一直沒(méi)有統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)圖表描述所有的生物化學(xué)反應(yīng)、路徑和網(wǎng)絡(luò)?! ?
2005年,各國(guó)的研究人員開(kāi)始努力開(kāi)發(fā)一種專(zhuān)門(mén)用于分子和系統(tǒng)生物學(xué)研究的新圖表標(biāo)準(zhǔn),即SBGN項(xiàng)目。該項(xiàng)目由日本東京系統(tǒng)生物學(xué)研究所的北野宏明發(fā)起,英國(guó)辛克斯頓歐洲生物信息學(xué)研究所的尼古拉斯·勒·諾瓦克和美國(guó)加州理工學(xué)院的邁克爾·胡克負(fù)責(zé)協(xié)調(diào)。研究團(tuán)隊(duì)則包括生物化學(xué)家、模型制作人員和計(jì)算機(jī)科學(xué)家?! ?/P>
勒·諾瓦克指出,在基因組學(xué)時(shí)代,特別是高通量技術(shù)出現(xiàn)之后,生物學(xué)數(shù)據(jù)的規(guī)??偭坑辛舜蠓仍鲩L(zhǎng),SBGN會(huì)使研究人員更容易了解彼此的模型,更有效地分享數(shù)據(jù)。它將使眾多的系統(tǒng)生物學(xué)家從中受益,無(wú)論他們研究的重點(diǎn)是生化進(jìn)程中的哪個(gè)環(huán)節(jié)。
為了確保新圖表不會(huì)變得過(guò)于龐大、復(fù)雜,研究人員定義了三種不同類(lèi)型的圖解,互相補(bǔ)充,描述分子過(guò)程、實(shí)體關(guān)系和生化活動(dòng)中的各個(gè)環(huán)節(jié)。報(bào)道稱(chēng),SBGN十分簡(jiǎn)單,有眾多研究團(tuán)體的廣泛參與,相信這種表示法將會(huì)迅速得到廣泛的應(yīng)用。