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qpcr實驗步驟及原理

日期:2023-07-27 14:43:38

    實時定量聚合酶鏈反應(quantitative polymerase chain reaction, qPCR)是一種常用的分子生物學技術,用于快速測定DNA或RNA樣本中特定序列的數(shù)量。以下是qPCR實驗的步驟及原理:
 
qpcr實驗步驟:
 
     提取核酸:從待檢測樣本(如細胞、組織或體液等)中提取目標DNA或RNA。
 
    反轉錄(僅適用于RNA樣本):如果提取的是RNA樣本,需進行逆轉錄反應,將RNA轉錄成相應的cDNA。
 
    預處理:對提取的DNA或cDNA進行預處理,如純化、去除污染物等。
 
    設計引物和探針:設計特異性引物和熒光探針,使其能夠在PCR過程中特異性地結合目標序列。
 
    準備反應體系:根據(jù)qPCR試劑盒的要求,配制反應體系,包括引物、探針、DNA模板、聚合酶、緩沖液等。
 
    執(zhí)行PCR循環(huán):將反應體系裝入熱循環(huán)儀,并按照設定的程序進行PCR循環(huán)。包括DNA變性、引物結合、擴增和熒光信號檢測等步驟。
 
    數(shù)據(jù)分析:根據(jù)熒光信號的增加情況,通過計算機軟件分析PCR循環(huán)階段閾值周期數(shù)(Ct值),進而計算出目標序列的相對數(shù)量。
 
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qpcr實驗原理:

    
qPCR基于傳統(tǒng)的聚合酶鏈反應(PCR)技術,通過逐漸擴增目標DNA或cDNA的數(shù)量使其可檢測。與傳統(tǒng)PCR不同的是,qPCR在擴增過程中同時進行熒光信號的實時監(jiān)測。
 
    qPCR的原理基于熒光探針(例如TaqMan探針或SYBR Green I染料)。這些探針通過與目標序列的特異性結合,在PCR過程中釋放熒光信號。
 
    SYBR Green I:該染料能與DNA雙鏈結合,當PCR擴增產(chǎn)生新的雙鏈DNA時,SYBR Green I與其結合并發(fā)出熒光信號。
 
    TaqMan探針:該探針由引物和熒光探針組成,熒光探針含有一個熒光染料和一個熒光猝滅劑。在PCR擴增過程中,熒光探針通過引物特異性結合到目標序列上,并且Taqpolymerase酵素的核酸酶活性會切除掉熒光探針上的猝滅劑,導致熒光染料釋放出信號。
 
    通過檢測PCR擴增過程中的熒光信號強度,可以確定目標序列相對起始數(shù)量。通常通過計算Ct值(熒光信號達到閾值的循環(huán)數(shù))來衡量目標序列的豐度。通過構建標準曲線或使用ΔCt方法,可以將待測樣本中目標序列的相對豐度與參考基因或對照組進行比較。