Nanodiscs在膜蛋白中的應(yīng)用
日期:2018-02-01 13:42:11
在上一期中,我們簡(jiǎn)單介紹了去垢劑的基本性質(zhì)及其在膜蛋白中的應(yīng)用。在含有去垢劑的緩沖中,大部分膜蛋白可以維持穩(wěn)定性和活性。但少數(shù)對(duì)去垢劑敏感的膜蛋白是不適宜含有去垢劑的緩沖條件的,具體表現(xiàn)為無(wú)法純化(例如純化出的膜蛋白十分雜且得率非常低),穩(wěn)定性不好(易于降解或有明顯沉淀)和沒(méi)有活性(可能該膜蛋白對(duì)去垢劑敏感,或其活性需要磷脂雙分子層的結(jié)構(gòu))。針對(duì)這類膜蛋白,我們建議嘗試nanodiscs技術(shù)。目前,Nanodiscs技術(shù)在膜蛋白的分離、純化、結(jié)構(gòu)研究和功能表征方面展現(xiàn)了重要的優(yōu)勢(shì)。本文介紹nanodiscs的成分和結(jié)構(gòu),nanodiscs與liposomes的對(duì)比以及nanodiscs在膜蛋白中的應(yīng)用。希望通過(guò)我們的介紹,可以幫助您進(jìn)一步了解膜蛋白。
1.Nanodiscs的成分和結(jié)構(gòu)
Nanodiscs的主要成分是合成磷脂和兩親性螺旋蛋白(amphipathic helical protein),也叫做膜支架蛋白(membrane scaffold protein,MSP)。膜支架蛋白與血清載脂蛋白相關(guān),而血清載脂蛋白是高密度脂蛋白的主要成分。2個(gè)膜支架蛋白為帶狀,環(huán)繞著磷脂,如下圖Fig 1[1],即盤狀磷脂雙分子層Nanodiscs。
2. 模型膜
我們主要對(duì)比liposomes和nanodiscs兩種模型膜。
2.1 Liposomes
Liposomes是兩親性脂雙層的囊泡。制備liposomes有許多方法,其中最有名最不要求設(shè)備的方法是Bangham法[2]。將目的脂質(zhì)溶解于揮發(fā)性有機(jī)溶劑中,在惰性氣流下干燥。用水溶性緩沖渦旋所得的薄層脂質(zhì),然后通過(guò)各種方法,例如超聲、均質(zhì)化和用尺寸已知的過(guò)濾器擠出(一般為100-200nm孔徑尺寸),最后轉(zhuǎn)化為單層囊泡。這也導(dǎo)致了liposomes非常明顯的劣勢(shì),不穩(wěn)定、不均質(zhì)、難以復(fù)制等。
Liposomes易于聚集和融合,通常在長(zhǎng)時(shí)間或在某些物理操作下是不穩(wěn)定的,例如停止流動(dòng)或劇烈混合。通過(guò)擠出機(jī)制備的liposomes尺寸并不是均質(zhì)的,不同批次制備可能存在明顯差異[3]。組裝入liposomes中的膜蛋白通常會(huì)導(dǎo)致樣品渾濁和粘稠,這可能會(huì)限制一些生物化學(xué)分析技術(shù)的應(yīng)用。
2.2 Nanodiscs
制備nanodiscs首先要準(zhǔn)備包含磷脂、膜支架蛋白和去垢劑的混合物,一旦除去去垢劑,剩余的成分即組裝為直徑為8-16nm的盤狀磷脂雙分子層,即nanodiscs[4]。Nanodiscs的直徑由MSP帶的長(zhǎng)度決定,當(dāng)磷脂與MSP處于最佳摩爾比時(shí),即形成均勻的nanodiscs。
對(duì)比liposomes,Nanodiscs的尺寸分布更加均質(zhì)(在一次制備中)和一致(在不同批次的制備中);nanodiscs有更加精準(zhǔn)的顆粒尺寸大小,可以通過(guò)調(diào)節(jié)MSP的序列長(zhǎng)度來(lái)調(diào)節(jié)大?。?span lang="EN-US">nanodiscs更加穩(wěn)定。
3.Nanodiscs在膜蛋白中的應(yīng)用
關(guān)于Nanodiscs的應(yīng)用,已經(jīng)有非常優(yōu)秀的綜述[5],關(guān)于結(jié)構(gòu)的研究可具體見(jiàn)下表,可應(yīng)用于結(jié)構(gòu)生物學(xué),適用于電子顯微鏡、NMR、EPR和光譜檢測(cè)技術(shù)等各種技術(shù)。
Table 1. Methods and tools used with MPs incorporated into nanodiscs
4.利用大腸無(wú)細(xì)胞蛋白表達(dá)和nanodiscs技術(shù)表達(dá)AQPs
Cusabio結(jié)合大腸無(wú)細(xì)胞蛋白表達(dá)和nanodiscs技術(shù),在大腸無(wú)細(xì)胞蛋白表達(dá)體系中加入預(yù)組裝的nanodiscs。膜蛋白邊翻譯邊組裝入nanodiscs里,形成膜蛋白-nanodiscs復(fù)合物(Fig 2.)。這種模擬的人造脂質(zhì)環(huán)境為分析不同的脂質(zhì)對(duì)膜蛋白的影響提供了新的途經(jīng),讓我們更好的理解膜蛋白。下圖Fig 3.為 Escherichia coli Aquaporin Z(aqpZ)成功組裝入nanodiscs后,SDS-PAGE的檢測(cè)結(jié)果。由圖可見(jiàn)有2條帶,一條為MSP,一條為目的膜蛋白aqpZ。
下圖Fig 3.為 Escherichia coli Aquaporin Z(aqpZ)成功組裝入nanodiscs后,SDS-PAGE的檢測(cè)結(jié)果。由圖可見(jiàn)有2條帶,一條為MSP,一條為目的膜蛋白aqpZ。
Fig 2. Schematic illustration of a MSP nanodiscs with a 7-transmembrane protein embedded.Diameter is about 10.6 nm. Picture from Sligar.
Fig 3.
Cusabio表達(dá)膜蛋白新方案
提供無(wú)風(fēng)險(xiǎn)膜蛋白表達(dá)服務(wù)(去垢劑方案)和300aa以下的無(wú)風(fēng)險(xiǎn)組裝入nanodics服務(wù)。歡迎咨詢!
往期回顧:
Detergent的性質(zhì)及其在膜蛋白中的應(yīng)用
Refenrences
[1] Applications of Phospholipid Bilayer Nanodiscs in the Study of Membranes and Membrane Proteins. Abhinav Nath, William M. Atkins, and Stephen G. Sligar. Biochemistry, 2007, 46 (8), 2059-2069
[2] Large volume liposomes by an ether vaporization method. D Deamer, AD Bangham. Biochimica et Biophysica Acta, 443 (1976) 629-~34
[3] Applications of Phospholipid Bilayer Nanodiscs in the Study of Membranes and Membrane Proteins. Abhinav Nath, William M. Atkins, and Stephen G. Sligar. Biochemistry, 2007, 46 (8), 2059-2069
[4] Self-assembly of discoidal phospholipid bilayer nanoparticles with membrane scaffold proteins. Timothy H. Bayburt,Yelena V. Grinkova, and Stephen G. Sligar. Nano Letters, 2002, 2 (8), pp 853–856
[5]Nanodiscs for structural and functional studies of membrane proteins.Ilia G Denisov & Stephen G Sligar.Nature Structural & Molecular Biology 23, 481–486 (2016)