長(zhǎng)鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是長(zhǎng)度大于 200 個(gè)核苷酸的非編碼 RNA。研究表明lncRNA作為一種重要的基因調(diào)控模式參了多種生物過(guò)程例如表觀遺傳調(diào)控、細(xì)胞周期調(diào)控、腫瘤發(fā)生和轉(zhuǎn)移等。通過(guò)研究lncRNA的生物學(xué)功能及其在疾病中的調(diào)控機(jī)制，能夠更加全面深入地理解疾病發(fā)生的分子機(jī)理，并有望發(fā)現(xiàn)新的疾病診斷標(biāo)志物以及治療靶點(diǎn)，是目前生命科學(xué)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。

中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所葛峰課題組采用基于生物質(zhì)譜分析的體內(nèi)標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)，系統(tǒng)、深入研究了一種重要的腫瘤相關(guān)LncRNA即HOTAIR的蛋白調(diào)控網(wǎng)絡(luò)；將SILAC（stable isotope labeling by amino acids in cell culture）方法應(yīng)用于lncRNA的功能研究中，構(gòu)建了HOTAIR的蛋白調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)HOTAIR參與調(diào)控多種重要生物學(xué)過(guò)程，尤其是細(xì)胞骨架和線粒體相關(guān)的生理活動(dòng)。

深入的功能研究結(jié)果表明，HOTAIR可以通過(guò)上調(diào)一種關(guān)鍵的細(xì)胞骨架蛋白—vimentin (VIM)的表達(dá)來(lái)調(diào)控腫瘤細(xì)胞的遷移和侵襲.抑制HOTAIR的表達(dá)還會(huì)導(dǎo)致線粒體的功能紊亂以及超微結(jié)構(gòu)的變化，提示HOTAIR的正常表達(dá)在維持癌細(xì)胞線粒體功能方面也起著重要作用。通過(guò)整合定量蛋白質(zhì)組學(xué)和功能研究的結(jié)果，研究人員提出了HOTAIR調(diào)控腫瘤細(xì)胞遷移和侵襲的分子機(jī)制模型。

研究結(jié)果表明，SILAC技術(shù)是系統(tǒng)研究和鑒定非編碼RNA的調(diào)控蛋白網(wǎng)絡(luò)和功能靶標(biāo)的高效且可靠的方法，可以從動(dòng)態(tài)和整體的角度闡明細(xì)胞或生物體非編碼RNA的蛋白調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和分子作用機(jī)制，有望成為非編碼RNA功能研究的不可或缺的工具.該研究成果已經(jīng)在線發(fā)表在國(guó)際蛋白質(zhì)組學(xué)專業(yè)雜志Molecular & Cellular Proteomics上。