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何川教授點(diǎn)評(píng)RNA甲基化重要成果

日期:2015-03-24 08:53:22

 眾所周知,DNA和組蛋白的表觀遺傳學(xué)修飾是基因表達(dá)調(diào)控的關(guān)鍵。不過,人們對(duì)RNA上的類似修飾還知之甚少。m6AN6-methyladenosine)是真核生物中最常見的mRNA內(nèi)部修飾。盡管人們四十年前就已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了它的存在,但研究者們才剛剛開始理解m6A的生物學(xué)功能。

 

m6A甲基化是人們發(fā)現(xiàn)的首個(gè)可逆性RNA修飾。之前的全轉(zhuǎn)錄組分析,揭示了m6A在哺乳動(dòng)物細(xì)胞和組織中的分布模式。這種修飾是哺乳動(dòng)物所必需的,可能與細(xì)胞分化和發(fā)育有關(guān)。

 

著名華人學(xué)者,芝加哥大學(xué)的何川(Chuan He)教授日前在Genome Biology雜志上發(fā)表文章,通過點(diǎn)評(píng)m6A研究的最新進(jìn)展,探討了這種修飾的功能和作用機(jī)制。

 

m6A決定胚胎干細(xì)胞的命運(yùn)

 

今年一月份Geula等人在Science雜志上發(fā)表文章,展示了m6A甲基化在小鼠胚胎干細(xì)胞(mESC)起到的重要作用。研究表明,m6A能夠結(jié)束mESC的原始態(tài)多能性,促進(jìn)其進(jìn)行分化。

 

胚胎干細(xì)胞來源于早期胚胎,具有分化為任何細(xì)胞類型的潛力。小鼠胚胎干細(xì)胞分為原始態(tài)多能性(Naïve pluripotency)和始發(fā)態(tài)多能性(primed pluripotency)兩種狀態(tài),始發(fā)態(tài)多能性是原始態(tài)多能性之后的發(fā)育階段,已經(jīng)為分化做好了準(zhǔn)備。

 

Geula等人通過siRNA篩選發(fā)現(xiàn),m6A轉(zhuǎn)移酶Mettl3是終結(jié)小鼠原始態(tài)多能性的一個(gè)重要調(diào)控子。全轉(zhuǎn)錄組分析顯示,原始態(tài)多能性基因和定量分化基因的轉(zhuǎn)錄本80%被甲基化,也就是說胚胎干細(xì)胞的原始態(tài)和始發(fā)態(tài)都受到m6A的控制。研究人員發(fā)現(xiàn),甲基化會(huì)縮短mRNA的半衰期,減少其豐度。也就是說,去除METTL3會(huì)增加已表達(dá)基因的豐度和支配性。舉例來說,在原始態(tài)中占主導(dǎo)的是多能性基因,去除m6A甲基化就會(huì)把細(xì)胞困在這個(gè)狀態(tài)。

 

深挖表型背后的機(jī)制

 

何川教授指出,從目前的研究來看,m6A會(huì)降低mRNA轉(zhuǎn)錄本的穩(wěn)定性。小鼠胚胎干細(xì)胞的表型由占主導(dǎo)地位的轉(zhuǎn)錄本決定,而去除m6A會(huì)加強(qiáng)這一趨勢(shì)。雖然人們還不清楚m6A是如何影響mRNA穩(wěn)定性的,不過這可能與YTHDF2有關(guān)。

 

除了調(diào)節(jié)mRNA穩(wěn)定性以外,m6A可能也會(huì)影響RNA剪切和其他RNA加工過程??偟膩碚f,每發(fā)現(xiàn)一個(gè)m6A特異性結(jié)合蛋白(或“讀取器”),就應(yīng)該有一個(gè)相應(yīng)的功能。因此,鑒定和分析m6A特異性結(jié)合蛋白對(duì)研究m6A功能很有幫助,可以揭示m6A在細(xì)胞分化和發(fā)育中的具體作用。