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單細胞研究強調(diào)了AML的克隆多樣性

日期:2015-04-03 08:55:14

 弗雷德•哈欽森癌癥研究中心(Fred Hutchinson Cancer Research Center)等機構(gòu)的研究人員近日在《科學(xué)-轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)》上在線發(fā)表新成果。他們利用單細胞基因分型方法,證實了急性髓系白血?。?/span>AML)的克隆多樣性。

 

研究小組利用基于多重PCR的方法來評估7AML樣本中單個細胞的突變模式,重點在頻繁突變的FLT3NPM1基因。他們發(fā)現(xiàn),每個樣本都包含9個或更多不同的克隆群,其中FLT3NPM1的一個或兩個拷貝都存在突變,顯示腫瘤中復(fù)雜的多樣性。

 

這篇文章的資深作者、弗雷德•哈欽森癌癥研究中心的Jerald Radich表示,這項工作表明AML中的腫瘤異質(zhì)性已超出了目前的理解,這對于治療方法的開發(fā)很重要,有望控制克隆演化引起的復(fù)發(fā)。

 

之前的研究指出,克隆多樣性在腫瘤發(fā)生中扮演著重要的角色,從腫瘤發(fā)展到結(jié)果及耐藥性。突變等位基因的追蹤,現(xiàn)在往往通過新一代測序來開展。對于目前的研究,Radich和他的同事推測,他們通過仔細追蹤單個細胞中的關(guān)鍵突變,而不是拼湊大量的DNA序列數(shù)據(jù),能夠更細致地了解AML演化。

 

考慮到這一點,研究人員首先在細胞系以及同一名AML患者的近600個分選細胞中驗證了多重PCR的突變分析,證明這種方法能夠準(zhǔn)確檢測FLT3的內(nèi)部串聯(lián)重復(fù)(FLT3-ITD)及NPM1基因的插入。接著,研究小組將注意力轉(zhuǎn)移到7AML樣本,之前的研究表明它們至少攜帶一個FLT3-ITDNPM1突變。之后,研究人員總結(jié)了每個細胞中的突變類型。

 

單細胞分析表明,FLT3NPM1的突變存在于純合和雜合狀態(tài)下,分布在所有樣品的至少9個克隆群中。對于不同位點含有突變的細胞,似乎存在著趨同進化和差分進化的軌跡。

 

作者寫道:“我們的數(shù)據(jù)表明,基于并發(fā)突變的克隆結(jié)構(gòu)可能要比根據(jù)大量等位基因頻率的設(shè)想更為復(fù)雜。突變只出現(xiàn)于雜合狀態(tài)下的假設(shè)可能低估了克隆多樣性。”

 

通過跟蹤兩名患者在診斷和復(fù)發(fā)時發(fā)現(xiàn)的FLT3NPM1突變,研究人員發(fā)現(xiàn)克隆復(fù)雜性的轉(zhuǎn)變可能伴隨著復(fù)發(fā)。在復(fù)發(fā)的AML腫瘤中,FLT3-ITD改變有所增加。不過他們的研究也表明,其他的突變亞克隆在疾病發(fā)展過程中傾向于待在原地。

 

特別關(guān)注