Science子刊:用CRISPR攻克致命感染
日期:2015-04-09 09:01:24
Whitehead研究所的研究人員改進(jìn)了CRISPR-Cas基因組編輯系統(tǒng),使其能夠全面操縱白色念珠菌(Candida albicans)的基因組,這一技術(shù)將幫助人們找到更多的新治療靶標(biāo)。
“這項(xiàng)研究是很有意義的,”領(lǐng)導(dǎo)這項(xiàng)研究的Gerald Fink教授說。“之前我們對這種致病菌的攻擊策略并不十分有效,而CRISPR解開了我們受到的束縛。”
白色念珠菌是一種生活在我們皮膚或者腸道中的常見微生物,通常是無害的。不過白色念珠菌對免疫功能低下的人特別危險(xiǎn),會引起可能致命的感染。這種致病菌相當(dāng)令人頭疼,因?yàn)樵S多菌株對抗真菌藥物有抗性,亟需開發(fā)出新的治療藥物。
要在致病菌中鑒定新藥物靶標(biāo),我們可以將其基因一一敲除,尋找那些致病菌賴以生存的基因。不過白色念珠菌的基因組特別難破解,現(xiàn)有的基因組編輯方法并不能有效敲除其基因的兩個(gè)拷貝。
規(guī)律成簇的間隔短回文重復(fù)CRISPR與內(nèi)切酶Cas9的組合,原本是細(xì)菌抵御病毒的重要武器,2012年,這個(gè)細(xì)菌免疫系統(tǒng)被人們開發(fā)成了基因組編輯工具。現(xiàn)在,CRISPR-Cas已經(jīng)成為了時(shí)下最熱門的基因組編輯系統(tǒng),Cas蛋白可以說是基因工程中的瑞士軍刀,能夠結(jié)合并切割任意DNA。
CRISPR-Cas能夠精確高效的編輯絕大多數(shù)二倍體生物的兩個(gè)基因拷貝。然而,標(biāo)準(zhǔn)CRISPR-Cas系統(tǒng)也對白色念珠菌獨(dú)特的遺傳學(xué)組成束手無策,需要進(jìn)行相當(dāng)大的改動。Fink實(shí)驗(yàn)室的Valmik Vyas經(jīng)過大量的努力,終于設(shè)計(jì)出了能夠作用于白色念珠菌和其他絕大多數(shù)真菌的CRISPR系統(tǒng)。這一成果發(fā)表在本周的Science Advances雜志上。
Vyas用自己開發(fā)的系統(tǒng)編輯了實(shí)驗(yàn)室菌株和臨床菌株。研究顯示,CRISPR-Cas能夠在一次實(shí)驗(yàn)中讓不同基因的兩個(gè)拷貝同時(shí)突變,包括涉及抗生素抗性的一些基因和一個(gè)必需基因。研究人員指出,改進(jìn)后的CRISPR-Cas系統(tǒng)能夠靶標(biāo)白色念珠菌98%的基因組。也就是說,現(xiàn)在人們可以在6000個(gè)基因中鑒定新的藥物靶標(biāo)。