發(fā)布在11月11日《自然》（Nature）雜志上的一篇新研究論文，報(bào)告了Oropetium thomaeum幾乎很完整的基因草圖。Oropetium thomaeum是一種耐旱草類，在遭受極端干旱后當(dāng)獲得水分之時(shí)會再度生長。

Donald Danforth植物科學(xué)中心研究人員及合作者，采用PacBio RS II測序系統(tǒng)以72x覆蓋度分析了這一植物245 Mb的基因組。序列組裝達(dá)到99.99995%的精度，包括了端粒和著絲粒序列、長末端重復(fù)序列反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子、串聯(lián)重復(fù)基因，和其他難于組裝的基因組元件。通過Pacific Biosciences公司“世界上最有趣的基因組”資助項(xiàng)目測序這一植物，幫助科學(xué)家們確定了Oropetium thomaeum極端耐旱背后的生物學(xué)機(jī)制，這一知識有潛力應(yīng)用于作物改良中。

資深作者Todd Mockler說：“我們之所以會向PacBio提出測序復(fù)活草Oropetium thomaeum這一想法，是因?yàn)樵诓蓊愔兴哂凶钚〉幕蚪M。獲得一種高度耐旱物種的基因組草圖可非常強(qiáng)有力地推動作物改良，并為植物比較基因組學(xué)研究團(tuán)隊(duì)提供了一個(gè)有價(jià)值的資源。通過這次合作獲得的信息是努力在不影響收益的條件下，持續(xù)提高重要糧食和能源作物在干旱條件下生存能力的重要一步。”

這一草類之所以被稱作為復(fù)活植物，是因?yàn)樗軌蛟谏衬畼拥臈l件下存活；甚至在看起來毫無生氣時(shí)，它仍然有三分之一的初始含水量。這種微小的C4草生長在非洲和印度部分地區(qū)的外露巖石上，與主要糧食作物、飼料作物和生物能作物親緣關(guān)系密切，給予少量的水它就能復(fù)原，重新開始生長。這一Oropetium基因組序列將可以幫助了解新耐旱機(jī)制以實(shí)現(xiàn)有效、高產(chǎn)的農(nóng)業(yè)土地利用。

Pacific Biosciences公司首席科學(xué)官Jonas Korlach說：“我們的客戶告訴我們，單分子實(shí)時(shí)(SMRT)測序可以幫助他們獲得有關(guān)研究生物體的全新研究發(fā)現(xiàn)。擁有高質(zhì)量的基因組序列裝配，靶向測序極其復(fù)雜的區(qū)域，及研究全長亞型及表觀遺傳學(xué)的能力，PacBio技術(shù)描繪出了其他測序技術(shù)無法提供的真正全面的生物學(xué)視圖。”