一個防御蛋白如何“叛變”致癌
日期:2016-01-26 09:13:17
癌癥是由攜帶DNA突變(DNA復(fù)制過程中發(fā)生的“復(fù)制錯誤”)的異常細(xì)胞增殖引起的。如果這些錯誤經(jīng)常發(fā)生而對生物沒有任何破壞性影響,那么其中一些就會影響基因組的特定部分,并引起突變細(xì)胞的增殖,然后侵入機(jī)體。即便一個小小的單堿基突變,也會導(dǎo)致癌癥,例如,2015年11月,兒童腫瘤學(xué)研究人員發(fā)現(xiàn)了一個至關(guān)重要的DNA單堿基改變,使得兒童易于罹患一種侵襲性的兒童癌癥——神經(jīng)母細(xì)胞瘤,并在腫瘤形成后推動了疾病進(jìn)展,這項(xiàng)研究發(fā)布《自然》(Nature)雜志上。
而有一些基因和蛋白,它們平時在體內(nèi)發(fā)揮有利的作用,一旦遇到合適的機(jī)會,就可能發(fā)生“叛變”,誘導(dǎo)癌癥的發(fā)生。例如,2014年6月,來自克利夫蘭醫(yī)學(xué)中心的研究人員在《Cell》雜志發(fā)表的一項(xiàng)研究表明,一種在促血管生產(chǎn)中起關(guān)鍵作用的蛋白,存在從前未知的變異體,其可抑制腫瘤生長,減慢新血管形成——這是癌癥轉(zhuǎn)移的一個必要條件。在2015年11月,來自美國Wistar研究所、第二軍醫(yī)大學(xué)和南京大學(xué)等處的研究人員發(fā)現(xiàn),在許多癌癥患者中發(fā)生突變的SPOP基因,當(dāng)發(fā)揮正常功能時,則充當(dāng)了一個抑癌基因,從而為我們展現(xiàn)了一個基因致癌或抑癌的善惡兩面。
幾年前,科學(xué)家們發(fā)現(xiàn),在我們自己的細(xì)胞中有一個重要突變原:APOBEC,這個蛋白的功能通常是作為保護(hù)劑對抗病毒感染。近期,瑞士和俄羅斯的一個科學(xué)家小組,在瑞士日內(nèi)瓦大學(xué)(UNIGE)遺傳學(xué)家Sergey Nikolaev的帶領(lǐng)下發(fā)現(xiàn), APOBEC能夠利用我們DNA復(fù)制過程中的一個弱點(diǎn),來誘發(fā)我們基因組中的突變。
APOBEC是一種有用、但危險的內(nèi)嵌細(xì)胞蛋白。它主要是為了對抗病毒,它只有改性單鏈DNA(通常是單鏈的病毒DNA)的力量。因此,我們的雙鏈人類DNA應(yīng)該不會被改變。但是,研究人員已經(jīng)觀察到, APOBEC誘導(dǎo)的突變,可能存在于許多腫瘤細(xì)胞中,遍及整個基因組。APOBEC——可能只影響單鏈DNA,是如何成為人類許多癌癥的原因呢?科學(xué)家已經(jīng)提出證據(jù)表明,約20%來的APOBEC突變來自于DNA中的一種異常,稱之為“雙鏈斷裂”,一段時間后,這種異常會使DNA處于一種單鏈的狀態(tài)。正是在這個特別的時刻,APOBEC造成了多個突變。但是如果這種機(jī)制占APOBEC相關(guān)突變的20%,UNIGE的科學(xué)家和莫斯科的同事能夠理解調(diào)控剩余80%的機(jī)制。
DNA復(fù)制的機(jī)器
在細(xì)胞分裂過程中,DNA必須根據(jù)一個精確的過程和時間進(jìn)行復(fù)制,才能從原來的DNA產(chǎn)生2個相同的拷貝。復(fù)制起始于一個特定位置。然后,兩條原始鏈的分離和新鏈的合成,會產(chǎn)生一個復(fù)制叉:隨著復(fù)制叉沿染色體移動,新鏈被重新構(gòu)建。在DNA復(fù)制過程中,兩條鏈通過不同的機(jī)制進(jìn)行復(fù)制,這些機(jī)制取決于復(fù)制叉的方向。如果其中一條鏈被立刻構(gòu)建起來,第二條鏈就不可能被快速重建。因此,一條鏈——“領(lǐng)先鏈,”從來不作為單鏈DNA而存在,而另一條鏈——“滯后鏈”,仍然作為一條單鏈存在一段時間。
Sergey Nikolaev解釋說:“既然我們知道,APOBEC只能使單鏈DNA發(fā)生突變,那么,為了識別單鏈停留時間更長的DNA區(qū)域,我們就需要確定復(fù)制叉的方向。我們第一次成功地在人類細(xì)胞中做到了這一點(diǎn)。我們能夠識別大約20%的基因組的復(fù)制叉方向,與‘領(lǐng)先鏈’相比,我們在‘滯后鏈’上發(fā)現(xiàn)了多達(dá)兩倍的突變。”有了這一發(fā)現(xiàn),科學(xué)家們有證據(jù)表明,APOBEC可能投機(jī)取巧地利用“滯后鏈”仍然是單鏈的瞬間,從而更弱。
影響我們最重要基因的那些突變
DNA復(fù)制程序是非常保守的:它開始于一個定義良好的起點(diǎn)。我們最重要和最受保護(hù)的基因在早期復(fù)制,而一些不太重要的基因則在晚些時候才被復(fù)制。通常情況下,在后期復(fù)制的基因組區(qū)域中,突變率在三倍以上。
本文第一作者、俄羅斯科學(xué)院的Vladimir Seplyarskiy解釋說:“我們很驚訝地觀察到,在APOBEC癌癥中,突變率均勻分布在所有區(qū)域。當(dāng)APOBEC參與進(jìn)來時,突變發(fā)生在復(fù)制的早期,并影響重要的基因。因此,這些突變的傾向,要比其他類型的突變更有害。我們?nèi)匀徊恢罏槭裁?,?span lang="EN-US">APOBEC似乎充當(dāng)受影響的細(xì)胞中的復(fù)制機(jī)制的一個默認(rèn)標(biāo)志,為投機(jī)取巧的突變原大開方便之門。事實(shí)上,早期復(fù)制的基因區(qū)域不應(yīng)該在一個單鏈狀態(tài)停留足夠長的時間,以便于APOBEC行動。這意味著,甚至在APOBEC出現(xiàn)之前,就有什么事情出了錯。”科學(xué)家們將繼續(xù)他們的研究,更好地了解“腫瘤細(xì)胞如何從健康細(xì)胞差異性地復(fù)制它們的DNA”。