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Your Good Partner in Biology Research

Nature:別讓環(huán)境因素毀了你的小鼠實驗

日期:2016-02-17 09:25:21

 小鼠模型是生物學和醫(yī)學研究中普遍使用的一個基本工具,然而小鼠實驗的結(jié)果有時候很難重復。在上周Wellcome Genome Campus舉行的一次會議上,研究者們?nèi)嫣接懥擞绊懶∈笱芯拷Y(jié)果多種生物學因素。

 

我們的論文很少提及一些看似“無關(guān)緊要”的環(huán)境因素,比如小鼠的飲食、睡眠或者光照情況。實際上已經(jīng)有不少研究表明這些因素能對小鼠產(chǎn)生顯著影響,不同的環(huán)境條件會使小鼠實驗的結(jié)果產(chǎn)生很大差異。

 

加州大學的Christopher Colwell就遇到了這樣的問題。他和同事用同一個轉(zhuǎn)基因小鼠系研究自閉癥,卻在同樣的行為測試中得到了不同的結(jié)果。他們最后發(fā)現(xiàn)問題出在小鼠的晝夜節(jié)律上。小鼠是夜行性生物,但行為測試是在白天進行的。為了增強小鼠的敏銳性,Colwell讓它們在白天處于黑暗中,而他的同事沒有這樣做。Colwell指出,無視小鼠的晝夜節(jié)律會影響許多行為實驗的結(jié)果。當然,如果我們大半夜的去考試,多半也拿不到好成績。

 

營養(yǎng)也能決定一項小鼠研究的成敗。很多研究者可能從不關(guān)心小鼠吃的是什么。事實上一些飼料含有干擾雌激素和內(nèi)分泌的物質(zhì),會影響癌癥和一些疾病研究的結(jié)果。此外,肥胖研究中使用的高脂高糖飼料容易腐臭。這時小鼠就會停止進食并很快瘦下來,而你可能還不知道發(fā)生了什么。

 

食物還能改變小鼠的腸道微生物組。Jackson實驗室的Catherine Hagan Gillespie表示,來自不同供應商的小鼠,腸道菌的種類差異很大。她在一項還未發(fā)表的研究中發(fā)現(xiàn),腸道菌組成會影響小鼠的行為測試,使其表現(xiàn)出不同程度的焦慮。

 

這類研究很少會評估微生物組,Hagan Gillespie說。然而小鼠微生物組對很多因素敏感,比如空氣質(zhì)量、母體的壓力和免疫功能。腸道微生物組的差異會使攜帶相同遺傳突變的小鼠擁有不同的表型,Jackson實驗室的George Weinstock指出。Jackson實驗室一直致力于培育和提供研究用小鼠,他們正計劃為用戶提供特殊飼料和培養(yǎng)指南,以確保小鼠實驗的質(zhì)量。

 

小鼠模型在醫(yī)學研究中到底好不好用,這個問題還存在一定的爭議。2013Seok等人的研究顯示,小鼠模型的基因表達不能很好的模擬人類炎癥性疾病。這篇文章發(fā)表之后在科學界中引起了很大的反響,也受到了紐約時報、CBS News等大眾媒體的廣泛關(guān)注。201408月日本科學家采用更恰當也更靈敏的方法,重新分析了Seok等人所用的數(shù)據(jù)集。他們發(fā)現(xiàn)Seok等人的分析方法并不恰當,實際上結(jié)果應該是完全相反的。

 

就在幾個月之后,斯坦福大學的研究團隊發(fā)表文章質(zhì)疑了小鼠與人類基因表達的相似性。他們在15種組織中比較了人類和小鼠的基因表達情況,包括大腦、心臟、肝臟、腎臟等等。研究顯示,人類和小鼠的基因表達存在著驚人的差異,不論是蛋白編碼基因還是非編碼基因。“我們認為人類和小鼠在遺傳學上非常類似,但它們的轉(zhuǎn)錄組差異其實很大。”

 

Nature Methods雜志也發(fā)表過一項很有意思的研究。研究人員發(fā)現(xiàn),男性實驗員的出現(xiàn)會使小鼠和大鼠感到壓力山大,進而對研究結(jié)果產(chǎn)生不小的影響。這項研究表明,男性實驗員的出現(xiàn)會令小鼠和大鼠產(chǎn)生壓力應答,這種壓力相當于將它們束縛在管子里15分鐘,或者強迫它們游泳三分鐘。這些小鼠和大鼠(不論雌雄)在行為測試中對疼痛不那么敏感。

 

特別關(guān)注